| General Information: |
|
| Name(s) found: |
COP1 /
YDL145C
[SGD]
|
| Description(s) found:
SHOW ONLY BEST |
|
| Organism: | Saccharomyces cerevisiae |
| Length: | 1201 amino acids |
Gene Ontology: |
|
| Cellular Component: |
COPI vesicle coat
[IMP ][ISS]
|
| Biological Process: |
ER to Golgi vesicle-mediated transport
[IMP]
retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to ER [IMP ]
|
| Molecular Function: |
molecular_function
[ND]
|
| Sequence: |
|
| Sequence: [PDR BLAST] [ProtParam] |
1 11 21 31 41 51
| | | | | |
1 MKMLTKFESK STRAKGIAFH PSRPWVLVAL FSSTIQLWDY RMGTLLHRFE DHEGPVRGLD 60
61 FHPTQPIFVS AGDDYTIKVW SLDTNKCLYT LTGHLDYVRT VFFHRELPWI ISASDDQTIR 120
121 IWNWQNRKEI ACLTGHNHFV MCAQFHPTDD LIVSASLDET IRIWDISGLR KRHSAPGTSS 180
181 FEEQMSAQQN LLDGSLGDCV VKFILEGHTR GVNWASFHPT LPLIVSGSDD RQVKLWRMSA 240
241 TKAWEVDTCR GHTNNVDSVI FHPHQNLIIS VGEDKTLRVW DLDKRTPVKQ FKRENDRFWL 300
301 IAAHPHINLF GAAHDSGIMV FKLDRERPCS FIHQNQLFFV NAEKQIQSFN FQKRVASLPY 360
361 ASLKGIGQPW DAFRSISYNP SQHSVLVNEA NGKFALVILP KQPVGAVEPT SVTQDTGNFA 420
421 TFVGRNRFVV YNKNTESVEV RSLENKVTRN IKVEETVRTI VAAGPGSVLV IHPREVILYD 480
481 VQQGKKVSQL AVKNVKYVSW SLDGQYVALM SKHTITLATK KLELINSMHE TIRIKSAAWD 540
541 ETGVLIYSTL NHIRYSLLNG DRGIIKTLEK TLYITKVQGK LVYCLNREGE IEILTIDPTE 600
601 YRFKKALVNK NFPEVLRLIK DSNLVGQNII SYLQKSGYPE IALQFVQDPH IRFDLALEYG 660
661 NLDVALDEAK KLNDSSTWER LIQEALAQGN ASLAEMIYQT QHSFDKLSFL YLVTGDVNKL 720
721 SKMQNIAQTR EDFGSMLLNT FYNNSTKERS SIFAEGGSLP LAYAVAKANG DEAAASAFLE 780
781 QAEVDEQDVT LPDQMDASNF VQRPVISKPL EKWPLKEAEL SYFEKAVLGQ IDDLTIDDET 840
841 PAVNTTQEQE EPLGEENFND EDIGEDEGAW DLGDEDLDVG EELPEEVEQG EITSPAQEVE 900
901 TAIWIKNSKL PAVLVAAGAF DAAVQALSKQ VGVVKLEPLK KYFTNIYEGC RTYIPSTPCE 960
961 LPAQLGYVRA YDDTVSEDQI LPYVPGLDVV NEKMNEGYKN FKLNKPDIAI ECFREAIYRI1020
1021 TLLMVDDAED EKLAHKILET AREYILGLSI ELERRSLKEG NTVRMLELAA YFTKAKLSPI1080
1081 HRTNALQVAM SQHFKHKNFL QASYFAGEFL KIISSGPRAE QARKIKNKAD SMASDAIPID1140
1141 FDPYAKFDIC AATYKPIYED TPSVSDPLTG SKYVITEKDK IDRIAMISKI GAPASGLRIR1200
1201 V |
The following runs contain data for this protein:
| BAIT | COMMENTS | PUBLICATION | |
| View Run | his-HA tag on RPA135 | Schneider, DA, et al. (2006) | |
| View Run | his-HA tag on RPA135 | Schneider, DA, et al. (2006) | |
| View Run | Dam1-765 complex purified from yeast with Dad1-TAP | Shimogawa MM, et al. (2006) | |
| View Run | sample cbf3 from feb 2005 | Sandall S, et all (2006) | |
| View Run | No Comments | Schneider, DA, et al. (2006) | |
| View Run | Sample 2- cpn2 from june 2005 | McCusker D, et al (2007) | |
| View Run | Sample 3 - cpn + atp, from june 2005 | McCusker D, et al (2007) | |
| View Run | Sample boi 1 with ha tag from october 2005 | McCusker D, et al (2007) | |
| View Run | Sample boi1 with gst from october 2005 | McCusker D, et al (2007) | |
| View Run | #32 Asynchronous Prep-No Phosphopeptide enrichment | Keck JM, et al. (2011) | |
| View Run | #29 Asynchronous Prep5-TiO2 Flowthrough | Keck JM, et al. (2011) | |
| View Run | #12 Mitotic Prep1-TiO2 Flowthrough | Keck JM, et al. (2011) | |
| View Run | #30 Asynchronous Prep6-TiO2 Phosphopeptide enrichment | Keck JM, et al. (2011) | |
| View Run | #11 Mitotic Prep1-TiO2 enriched, new search criteria | Keck JM, et al. (2011) |
SHOWING SINGLE HITS. [ Hide Single Hits ]
| BAIT | PREY | HITS | PUBLICATION | |
| View Screen | 1 | Unpublished Fields Lab Data |
New Feature: Upload Your Own Microscopy Data
Domains predicted:
| # | Region(s) | Method | Confidence | Match Description | |
| 1 | View Details | [1..324] |  |
217.211549 | Tup1, C-terminal domain |
| 2 | View Details | [325..443] | |
31.69897 | Groucho/tle1, C-terminal domain |
| 3 | View Details | [444..646] | |
3.420995 | View MSA. No confident structure predictions are available. |
| 4 | View Details | [647..792] | |
9.91 | Clathrin heavy chain proximal leg segment |
| 5 | View Details | [793..980] | |
N/A | No confident structure predictions are available. |
| 6 | View Details | [981..1088] | |
7.21 | Hop |
| 7 | View Details | [1089..1140] | |
7.21 | Hop |
| 8 | View Details | [1141..1201] | |
N/A | No confident structure predictions are available. |
Functions predicted (by domain):
| # | Gene Ontology predictions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 6 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 7 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8 | No functions predicted. |
| Source: Reynolds et al. 2008. Manuscript submitted |
|
