General Information: |
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Name(s) found: |
MOT1 /
YPL082C
[SGD]
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Description(s) found:
Found 26 descriptions. SHOW ALL |
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Organism: | Saccharomyces cerevisiae |
Length: | 1867 amino acids |
Gene Ontology: |
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Cellular Component: |
mitochondrion
[IDA![]() ![]() nuclear chromosome [IDA ![]() nuclear outer membrane [IMP ![]() |
Biological Process: |
transcription of nuclear rRNA large RNA polymerase I transcript
[IDA![]() ![]() regulation of RNA polymerase II transcriptional preinitiation complex assembly [IMP ![]() regulation of transcription from RNA polymerase II promoter [IDA ![]() |
Molecular Function: |
ATPase activity
[IDA![]() rDNA binding [IDA ![]() TATA-binding protein binding [IPI ![]() |
Sequence: |
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Sequence: [PDR BLAST] [ProtParam] |
1 11 21 31 41 51 | | | | | | 1 MTSRVSRLDR QVILIETGST QVVRNMAADQ MGDLAKQHPE DILSLLSRVY PFLLVKKWET 60 61 RVTAARAVGG IVAHAPSWDP NESDLVGGTN EGSPLDNAQV KLEHEMKIKL EEATQNNQLN 120 121 LLQEDHHLSS LSDWKLNEIL KSGKVLLASS MNDYNVLGKA DDNIRKQAKT DDIKQETSML 180 181 NASDKANENK SNANKKSARM LAMARRKKKM SAKNTPKHPV DITESSVSKT LLNGKNMTNS 240 241 AASLATSPTS NQLNPKLEIT EQADESKLMI ESTVRPLLEQ HEIVAGLVWQ FQGIYELLLD 300 301 NLMSENWEIR HGAALGLREL VKKHAYGVSR VKGNTREENN LRNSRSLEDL ASRLLTVFAL 360 361 DRFGDYVYDT VVAPVRESVA QTLAALLIHL DSTLSIKIFN CLEQLVLQDP LQTGLPNKIW 420 421 EATHGGLLGI RYFVSIKTNF LFAHGLLENV VRIVLYGLNQ SDDDVQSVAA SILTPITSEF 480 481 VKLNNSTIEI LVTTIWSLLA RLDDDISSSV GSIMDLLAKL CDHQEVLDIL KNKALEHPSE 540 541 WSFKSLVPKL YPFLRHSISS VRRAVLNLLI AFLSIKDDST KNWLNGKVFR LVFQNILLEQ 600 601 NPELLQLSFD VYVALLEHYK VKHTEKTLDH VFSKHLQPIL HLLNTPVGEK GKNYAMESQY 660 661 ILKPSQHYQL HPEKKRSISE TTTDSDIPIP KNNEHINIDA PMIAGDITLL GLDVILNTRI 720 721 MGAKAFALTL SMFQDSTLQS FFTNVLVRCL ELPFSTPRML AGIIVSQFCS SWLQKHPEGE 780 781 KLPSFVSEIF SPVMNKQLLN RDEFPVFREL VPSLKALRTQ CQSLLATFVD VGMLPQYKLP 840 841 NVAIVVQGET EAGPHAFGVE TAEKVYGEYY DKMFKSMNNS YKLLAKKPLE DSKHRVLMAI 900 901 NSAKESAKLR TGSILANYAS SILLFDGLPL KLNPIIRSLM DSVKEERNEK LQTMAGESVV 960 961 HLIQQLLENN KVNVSGKIVK NLCGFLCVDT SEVPDFSVNA EYKEKILTLI KESNSIAAQD1020 1021 DINLAKMSEE AQLKRKGGLI TLKILFEVLG PSILQKLPQL RSILFDSLSD HENEEASKVD1080 1081 NEQGQKIVDS FGVLRALFPF MSDSLRSSEV FTRFPVLLTF LRSNLSVFRY SAARTFADLA1140 1141 KISSVEVMAY TIREILPLMN SAGSLSDRQG STELIYHLSL SMETDVLPYV IFLIVPLLGR1200 1201 MSDSNEDVRN LATTTFASII KLVPLEAGIA DPKGLPEELV ASRERERDFI QQMMDPSKAK1260 1261 PFKLPIAIKA TLRKYQQDGV NWLAFLNKYH LHGILCDDMG LGKTLQTICI IASDQYLRKE1320 1321 DYEKTRSVES RALPSLIICP PSLTGHWENE FDQYAPFLKV VVYAGGPTVR LTLRPQLSDA1380 1381 DIIVTSYDVA RNDLAVLNKT EYNYCVLDEG HIIKNSQSKL AKAVKEITAN HRLILTGTPI1440 1441 QNNVLELWSL FDFLMPGFLG TEKMFQERFA KPIAASRNSK TSSKEQEAGV LALEALHKQV1500 1501 LPFMLRRLKE DVLSDLPPKI IQDYYCELGD LQKQLYMDFT KKQKNVVEKD IENSEIADGK1560 1561 QHIFQALQYM RKLCNHPALV LSPNHPQLAQ VQDYLKQTGL DLHDIINAPK LSALRTLLFE1620 1621 CGIGEEDIDK KASQDQNFPI QNVISQHRAL IFCQLKDMLD MVENDLFKKY MPSVTYMRLD1680 1681 GSIDPRDRQK VVRKFNEDPS IDCLLLTTKV GGLGLNLTGA DTVIFVEHDW NPMNDLQAMD1740 1741 RAHRIGQKKV VNVYRIITKG TLEEKIMGLQ KFKMNIASTV VNQQNSGLAS MDTHQLLDLF1800 1801 DPDNVTSQDN EEKNNGDSQA AKGMEDIANE TGLTGKAKEA LGELKELWDP SQYEEEYNLD1860 1861 TFIKTLR |
The following runs contain data for this protein:
  | BAIT | COMMENTS | PUBLICATION |
View Run | No Comments | Schneider, DA, et al. (2006) | |
View Run | #29 Asynchronous Prep5-TiO2 Flowthrough | Keck JM, et al. (2011) | |
View Run | #12 Mitotic Prep1-TiO2 Flowthrough | Keck JM, et al. (2011) | |
View Run | #30 Asynchronous Prep6-TiO2 Phosphopeptide enrichment | Keck JM, et al. (2011) | |
View Run | #11 Mitotic Prep1-TiO2 enriched, new search criteria | Keck JM, et al. (2011) |
NOT SHOWING SINGLE HITS. [ Show Single Hits ]
New Feature: Upload Your Own Microscopy Data
  | PROTEIN(S) | PUBLICATION |
View Data |
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Huh WK, et al. (2003) |
Domains predicted:
# | Region(s) | Method | Confidence | Match Description | |
1 | View Details | [1..266] | ![]() |
1.011923 | View MSA. No confident structure predictions are available. |
2 | View Details | [267..460] | ![]() |
N/A | No confident structure predictions are available. |
3 | View Details | [461..689] | ![]() |
1.01494 | View MSA. No confident structure predictions are available. |
4 | View Details | [690..1018] | ![]() |
N/A | No confident structure predictions are available. |
5 | View Details | [1019..1198] | ![]() |
2.326994 | View MSA. No confident structure predictions are available. |
6 | View Details | [1199..1269] | ![]() |
N/A | No confident structure predictions are available. |
7 | View Details | [1270..1583] | ![]() |
151.040959 | SNF2 family N-terminal domain No confident structure predictions are available. |
8 | View Details | [1584..1672] | ![]() |
N/A | No confident structure predictions are available. |
9 | View Details | [1673..1746] | ![]() |
24.638272 | Helicase conserved C-terminal domain No confident structure predictions are available. |
10 | View Details | [1747..1867] | ![]() |
7.580996 | View MSA. No confident structure predictions are available. |
Functions predicted (by domain):
# | Gene Ontology predictions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | No functions predicted. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | No functions predicted. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 |
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4 |
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5 | No functions predicted. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6 | No functions predicted. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 | No functions predicted. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8 | No functions predicted. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9 | No functions predicted. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10 | No functions predicted. |
Protein predicted to be: | GLOBULAR (No transmembrane regions or signal peptide) |
Confidence of classification: | 0.97 |
Source: Reynolds et al. (2008)