General Information: |
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Name(s) found: |
Dscam-PAA /
FBpp0110341
[FlyBase]
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Description(s) found:
SHOW ONLY BEST |
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Organism: | Drosophila melanogaster |
Length: | 2016 amino acids |
Gene Ontology: |
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Cellular Component: |
integral to plasma membrane
[ISS]
dendrite [IDA] neuronal cell body [IDA] axon [IDA] |
Biological Process: |
mushroom body development
[IMP]
dendrite self-avoidance [IDA][IMP] phagocytosis [IMP] axon guidance [IGI][IMP][TAS] peripheral nervous system development [IMP] neuron development [IMP] central nervous system morphogenesis [IMP] axonal fasciculation [IMP] axon extension involved in axon guidance [IMP] |
Molecular Function: |
protein binding
[IDA]
protein homodimerization activity [IPI] axon guidance receptor activity [IMP][NAS] bacterial cell surface binding [IDA] |
Sequence: |
|
Sequence: [PDR BLAST] [ProtParam] |
1 11 21 31 41 51 | | | | | | 1 MNMPNERLKW LMLFAAVALI ACGSQTLAAN PPDADQKGPV FLKEPTNRID FSNSTGAEIE 60 61 CKASGNPMPE IIWIRSDGTA VGDVPGLRQI SSDGKLVFPP FRAEDYRQEV HAQVYACLAR 120 121 NQFGSIISRD VHVRAVVNQY YEAEVVSEYV IRGNTAVLKC TIPSFVADFL RVEAWVASDG 180 181 TEYAPEEDFD GKYLVLPSGE LHIREVGPED GYKSYQCRTK HRLTGETRLS ATKGRLVITE 240 241 PVGSVGPKVE IKDKVGIFVA KSNSSLALLC PAQSYPIPAF RWYKFIEGTT RKQAVVLNDR 300 301 VKQVSGTLII KDAVVEDSGK YLCVVNNSVG GESVETVLTV TAPLSAKIDP PTQTVDFGRP 360 361 AVFTCQYTGN PIKTVSWMKD GKAIGHSEPV LRIESVKKED KGMYQCFVRN DQESAEASAE 420 421 LKLGGRFDPP VIRQAFQEET MEPGPSVFLK CVAGGNPTPE ISWELDGKKI ANNDRYQVGQ 480 481 YVTVNGDVVS YLNITSVHAN DGGLYKCIAK SKVGVAEHSA KLNVYGLPYI RQMEKKAIVA 540 541 GETLIVTCPV AGYPIDSIVW ERDNRALPIN RKQKVFPNGT LIIENVERNS DQATYTCVAK 600 601 NQEGYSARGS LEVQVMVLPQ IVPFDFGEET VNELDMVSAS CTVNKGDLPI DVAWTKNGGR 660 661 VYTNDGIVVT KTSTRMSVLS IESARARHAG NYSCVATNNA GETRQWAVLA VNVPPRWILE 720 721 PTDKAFAQGS DAKVECKADG FPKPQVTWKK AVGDTPGEYK DLKKSDNIRV EEGTLHVDNI 780 781 QKTNEGYYLC EAINGIGSGL SAVIMISVQA PPEFTEKLRN QTARRGEPAV LQCEAKGEKP 840 841 IGILWNMNNM RLDPKNDNRY TIREEILSTG VMSSLSIKRT ERSDSALFTC VATNAFGSDD 900 901 ASINMIVQEV PEMPYALKVL DKSGRSVQLS WAQPYDGNSP LDRYIIEFKR SRASWSEIDR 960 961 VIVPGHTTEA QVQKLSPATT YNIRIVAENA IGTSQSSEAV TIITAEEAPS GKPQNIKVEP1020 1021 VNQTTMRVTW KPPPRTEWNG EILGYYVGYK LSNTNSSYVF ETINFITEEG KEHNLELQNL1080 1081 RVYTQYSVVI QAFNKIGAGP LSEEEKQFTA EGTPSQPPSD TACTTLTSQT IRVGWVSPPL1140 1141 ESANGVIKTY KVVYAPSDEW YDETKRHYKK TASSDTVLHG LKKYTNYTMQ VLATTAGGDG1200 1201 VRSVPIHCQT EPDVPEAPTD VKALVMGNAA ILVSWRPPAQ PNGIITQYTV YSKAEGAETE1260 1261 TKTQKVPHYQ MSFEATELEK NKPYEFWVTA STTIGEGQQS KSIVAMPSDQ VPAKIASFDD1320 1321 TFTATFKEDA KMPCLAVGAP QPEITWKIKG VEFSANDRMR VLPDGSLLIK SVNRQDAGDY1380 1381 SCHAENSIAK DSITHKLIVL APPQSPHVTL SATTTDALTV KLKPHEGDTA PLHGYTLHYK1440 1441 PEFGEWETSE VSVDSQKHNI EGLLCGSRYQ VYATGFNNIG AGEASDILNT RTKGQKPKLP1500 1501 EKPRFIEVSS NSVSLHFKAW KDGGCPMSHF VVESKKRDQI EWNQISNNVK PDNNYVVLDL1560 1561 EPATWYNLRI TAHNSAGFTV AEYDFATLTV TGGTIAPSRD LPELSAEDTI RIILSNLNLV1620 1621 VPVVAALLVI IIAIIVICIL RSKGNHHKDD VVYNQTMGPG ATLDKRRPDL RDELGYIAPP1680 1681 NRKLPPVPGS NYNTCDRIKR GRGGLRSNHS TWDPRRNPNL YEELKAPPVP MHGNHYGHAH1740 1741 GNAECHYRHP GMEDEICPYA TFHLLGFREE MDPTKAMNFQ TFPHQNGHAG PVPGHAGTML1800 1801 PPGHPGHVHS RSGSQSMPRA NRYQRKNSQG GQSSIYTPAP EYDDPANCAE EDQYRRYTRV1860 1861 NSQGGSLYSG PGPEYDDPAN CAPEEDQYGS QYGGPYGQPY DHYGSRGSMG RRSIGSARNP1920 1921 GNGSPEPPPP PPRNHDMSNS SFNDSKESNE ISEAECDRDH GPRGNYGAVK RSPQPKDQRT1980 1981 TEEMRKLIER NETGPKQLQL QQANGAGFTA YDTMAV |
SHOWING SINGLE HITS. [ Hide Single Hits ]
New Feature: Upload Your Own Microscopy Data
Domains predicted:
# | Region(s) | Method | Confidence | Match Description | |
1 | View Details | [1..138] | 79.39794 | No description for 2v5sA was found. | |
2 | View Details | [139..817] | 58.045757 | Model of human carcinoembryonic antigen by homology modelling and curve-fitting to experimental solution scattering data | |
3 | View Details | [818..847] | 5.69897 | Solution structure of the fifth ig-like domain of human kin of IRRE like 3 | |
4 | View Details | [848..1375] | 29.0 | No description for 2v5yA was found. | |
5 | View Details | [1376..1592] | 24.0 | Fibronectin, different Fn3 modules | |
6 | View Details | [1593..1805] | N/A | No confident structure predictions are available. | |
7 | View Details | [1806..2016] | 1.126993 | View MSA. No confident structure predictions are available. |
Functions predicted (by domain):
# | Gene Ontology predictions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 |
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6 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 | No functions predicted. |
Source: Reynolds et al. 2008. Manuscript submitted |