General Information: |
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Name(s) found: |
SMC3_YEAST
[Swiss-Prot]
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Description(s) found: |
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Organism: | Saccharomyces cerevisiae S288c |
Length: | 1230 amino acids |
Gene Ontology: |
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Cellular Component: | NONE FOUND |
Biological Process: | NONE FOUND |
Molecular Function: | NONE FOUND |
Sequence: |
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Sequence: [PDR BLAST] [ProtParam] |
1 11 21 31 41 51 | | | | | | 1 MYIKRVIIKG FKTYRNETII DNFSPHQNVI IGSNGSGKSN FFAAIRFVLS DDYSNLKREE 60 61 RQGLIHQGSG GSVMSASVEI VFHDPDHSMI LPSGVLSRGD DEVTIRRTVG LKKDDYQLND 120 121 RNVTKGDIVR MLETAGFSMN NPYNIVPQGK IVALTNAKDK ERLQLLEDVV GAKSFEVKLK 180 181 ASLKKMEETE QKKIQINKEM GELNSKLSEM EQERKELEKY NELERNRKIY QFTLYDRELN 240 241 EVINQMERLD GDYNNTVYSS EQYIQELDKR EDMIDQVSKK LSSIEASLKI KNATDLQQAK 300 301 LRESEISQKL TNVNVKIKDV QQQIESNEEQ RNLDSATLKE IKSIIEQRKQ KLSKILPRYQ 360 361 ELTKEEAMYK LQLASLQQKQ RDLILKKGEY ARFKSKDERD TWIHSEIEEL KSSIQNLNEL 420 421 ESQLQMDRTS LRKQYSAIDE EIEELIDSIN GPDTKGQLED FDSELIHLKQ KLSESLDTRK 480 481 ELWRKEQKLQ TVLETLLSDV NQNQRNVNET MSRSLANGII NVKEITEKLK ISPESVFGTL 540 541 GELIKVNDKY KTCAEVIGGN SLFHIVVDTE ETATLIMNEL YRMKGGRVTF IPLNRLSLDS 600 601 DVKFPSNTTT QIQFTPLIKK IKYEPRFEKA VKHVFGKTIV VKDLGQGLKL AKKHKLNAIT 660 661 LDGDRADKRG VLTGGYLDQH KRTRLESLKN LNESRSQHKK ILEELDFVRN ELNDIDTKID 720 721 QVNGNIRKVS NDRESVLTNI EVYRTSLNTK KNEKLILEES LNAIILKLEK LNTNRTFAQE 780 781 KLNTFENDLL QEFDSELSKE EKERLESLTK EISAAHNKLN ITSDALEGIT TTIDSLNAEL 840 841 ESKLIPQEND LESKMSEVGD AFIFGLQDEL KELQLEKESV EKQHENAVLE LGTVQREIES 900 901 LIAEETNNKK LLEKANNQQR LLLKKLDNFQ KSVEKTMIKK TTLVTRREEL QQRIREIGLL 960 961 PEDALVNDFS DITSDQLLQR LNDMNTEISG LKNVNKRAFE NFKKFNERRK DLAERASELD1020 1021 ESKDSIQDLI VKLKQQKVNA VDSTFQKVSE NFEAVFERLV PRGTAKLIIH RKNDNANDHD1080 1081 ESIDVDMDAE SNESQNGKDS EIMYTGVSIS VSFNSKQNEQ LHVEQLSGGQ KTVCAIALIL1140 1141 AIQMVDPASF YLFDEIDAAL DKQYRTAVAT LLKELSKNAQ FICTTFRTDM LQVADKFFRV1200 1201 KYENKISTVI EVNREEAIGF IRGSNKFAEV |
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Domains predicted:
# | Region(s) | Method | Confidence | Match Description | |
1 | View Details | [1..50] | 2.69897 | Myosin S1 fragment, N-terminal domain; Myosin S1, motor domain | |
2 | View Details | [51..394] | 22.522879 | Heavy meromyosin subfragment | |
3 | View Details | [395..451] | N/A | No confident structure predictions are available. | |
4 | View Details | [452..539] [563..596] |
91.154902 | Smc hinge domain | |
5 | View Details | [540..562] [597..600] [618..636] |
91.154902 | Smc hinge domain | |
6 | View Details | [601..617] [637..663] |
91.154902 | Smc hinge domain | |
7 | View Details | [664..730] | 9.045757 | Tropomyosin | |
8 | View Details | [731..992] | 9.045757 | Tropomyosin | |
9 | View Details | [993..1045] | N/A | No confident structure predictions are available. | |
10 | View Details | [1046..1230] | 144.94696 | Smc head domain |
Functions predicted (by domain):
# | Gene Ontology predictions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 |
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2 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 |
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4 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10 | No functions predicted. |
Protein predicted to be: | GLOBULAR (No transmembrane regions or signal peptide) |
Confidence of classification: | 0.96 |
Source: Reynolds et al. (2008)