General Information: |
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Name(s) found: |
cdk9 /
SPBC32H8.10
[Sanger Pombe]
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Description(s) found:
Found 20 descriptions. SHOW ALL |
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Organism: | Schizosaccharomyces pombe |
Length: | 591 amino acids |
Gene Ontology: |
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Cellular Component: |
nucleus
[IDA]
P-TEFb-cap methyltransferase complex [IDA] positive transcription elongation factor complex b [NAS] |
Biological Process: |
phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain
[IMP]
regulation of gene-specific transcription elongation from RNA polymerase II promoter [IMP] transcription from RNA polymerase I promoter [IGI] protein amino acid phosphorylation [IDA] |
Molecular Function: |
ATP binding
[ISS]
protein binding [IGI][IPI] RNA polymerase II carboxy-terminal domain kinase activity [IDA] cyclin-dependent protein kinase activity [IDA] |
Sequence: |
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Sequence: [PDR BLAST] [ProtParam] |
1 11 21 31 41 51 | | | | | | 1 MKRSSSVSVE DEKSARRKLD VVPKLHFVGC SHLTDYHLME KLGEGTFGEV YKSQRRKDGK 60 61 VYALKRILMH TEKEGFPITA IREIKILKSI KHENIIPLSD MTVVRADKKH RRRGSIYMVT 120 121 PYMDHDLSGL LENPSVKFTE PQIKCYMKQL FAGTKYLHDQ LILHRDLKAA NLLIDNHGIL 180 181 KIADFGLARV ITEESYANKN PGLPPPNRRE YTGCVVTRWY RSPELLLGER RYTTAIDMWS 240 241 VGCIMAEMYK GRPILQGSSD LDQLDKIFRL CGSPTQATMP NWEKLPGCEG VRSFPSHPRT 300 301 LETAFFTFGK EMTSLCGAIL TLNPDERLSA SMALEHEYFT TPPYPANPSE LQSYSASHEY 360 361 DKRRKREQRD ANSHAFEQTA NGKRQFRFMT RGPSDPWYGI RRPNYNSQPQ YQRGSYNREG 420 421 GNMDRSRNVN YQPKRQQNFK PLTSDLPQKN SEFSETNAMN QTSNHSHADG QRYYRPEQDR 480 481 SQRLRNPSDY GRQGRQSSQS QQPAWNVSSR YQNNSKVQTT SRASENADTN KTQHNIKYID 540 541 SYVPEYSIAR QSANQKTNEQ HPSSTSLHQQ STSDLKSPSF HENSNVDDTP K |
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Domains predicted:
# | Region(s) | Method | Confidence | Match Description | |
1 | View Details | [1..379] | 81.39794 | Structure of CDK2/Cyclin A with PNU-292137 | |
2 | View Details | [380..591] | N/A | No confident structure predictions are available. |
Functions predicted (by domain):
# | Gene Ontology predictions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 |
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2 | No functions predicted. |
Protein predicted to be: | GLOBULAR (No transmembrane regions or signal peptide) |
Confidence of classification: | 0.99 |
Source: Reynolds et al. (2008)