General Information: |
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Name(s) found: |
Dscam-PBE /
FBpp0110371
[FlyBase]
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Description(s) found:
SHOW ONLY BEST |
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Organism: | Drosophila melanogaster |
Length: | 2031 amino acids |
Gene Ontology: |
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Cellular Component: |
integral to plasma membrane
[ISS]
dendrite [IDA] neuronal cell body [IDA] axon [IDA] |
Biological Process: |
mushroom body development
[IMP]
dendrite self-avoidance [IDA][IMP] phagocytosis [IMP] axon guidance [IGI][IMP][TAS] peripheral nervous system development [IMP] neuron development [IMP] central nervous system morphogenesis [IMP] axonal fasciculation [IMP] axon extension involved in axon guidance [IMP] |
Molecular Function: |
protein binding
[IDA]
protein homodimerization activity [IPI] axon guidance receptor activity [IMP][NAS] bacterial cell surface binding [IDA] |
Sequence: |
|
Sequence: [PDR BLAST] [ProtParam] |
1 11 21 31 41 51 | | | | | | 1 MNMPNERLKW LMLFAAVALI ACGSQTLAAN PPDADQKGPV FLKEPTNRID FSNSTGAEIE 60 61 CKASGNPMPE IIWIRSDGTA VGDVPGLRQI SSDGKLVFPP FRAEDYRQEV HAQVYACLAR 120 121 NQFGSIISRD VHVRAVVNQF YEAEIMTEYV IRGNAAVLKC SIPSFVADFV RVESWIDDEG 180 181 NVLSFSDNYD GKYLVLPSGE LHIREVGPED GYKSYQCRTK HRLTGETRLS ATKGRLVITE 240 241 PVGSVRPKVN PQDKHQFIDV ELASSYSLLC MAQSYPTPSF RWYKFIEGTT RKQAVVLNDR 300 301 VKQVSGTLII KDAVVEDSGK YLCVVNNSVG GESVETVLTV TAPLSAKIDP PTQTVDFGRP 360 361 AVFTCQYTGN PIKTVSWMKD GKAIGHSEPV LRIESVKKED KGMYQCFVRN DQESAEASAE 420 421 LKLGGRFDPP VIRQAFQEET MEPGPSVFLK CVAGGNPTPE ISWELDGKKI ANNDRYQVGQ 480 481 YVTVNGDVVS YLNITSVHAN DGGLYKCIAK SKVGVAEHSA KLNVYGLPYI RQMEKKAIVA 540 541 GETLIVTCPV AGYPIDSIVW ERDNRALPIN RKQKVFPNGT LIIENVERNS DQATYTCVAK 600 601 NQEGYSARGS LEVQVMVLPR IIPFAFEEGP AQVGQYLTLH CSVPGGDLPL NIDWTLDGQA 660 661 ISEDLGITTS RVGRRGSVLT IEAVEASHAG NFTCHARNLA GHQQFTTPLN VYVPPRWILE 720 721 PTDKAFAQGS DAKVECKADG FPKPQVTWKK AVGDTPGEYK DLKKSDNIRV EEGTLHVDNI 780 781 QKTNEGYYLC EAINGIGSGL SAVIMISVQA PPEFTEKLRN QTARRGEPAV LQCEAKGEKP 840 841 IGILWNMNNM RLDPKNDNRY TIREEILSTG VMSSLSIKRT ERSDSALFTC VATNAFGSDD 900 901 ASINMIVQEV PEMPYALKVL DKSGRSVQLS WAQPYDGNSP LDRYIIEFKR SRASWSEIDR 960 961 VIVPGHTTEA QVQKLSPATT YNIRIVAENA IGTSQSSEAV TIITAEEAPS GKPQNIKVEP1020 1021 VNQTTMRVTW KPPPRTEWNG EILGYYVGYK LSNTNSSYVF ETINFITEEG KEHNLELQNL1080 1081 RVYTQYSVVI QAFNKIGAGP LSEEEKQFTA EGTPSQPPSD TACTTLTSQT IRVGWVSPPL1140 1141 ESANGVIKTY KVVYAPSDEW YDETKRHYKK TASSDTVLHG LKKYTNYTMQ VLATTAGGDG1200 1201 VRSVPIHCQT EPDVPEAPTD VKALVMGNAA ILVSWRPPAQ PNGIITQYTV YSKAEGAETE1260 1261 TKTQKVPHYQ MSFEATELEK NKPYEFWVTA STTIGEGQQS KSIVAMPSDQ VPAKIASFDD1320 1321 TFTATFKEDA KMPCLAVGAP QPEITWKIKG VEFSANDRMR VLPDGSLLIK SVNRQDAGDY1380 1381 SCHAENSIAK DSITHKLIVL APPQSPHVTL SATTTDALTV KLKPHEGDTA PLHGYTLHYK1440 1441 PEFGEWETSE VSVDSQKHNI EGLLCGSRYQ VYATGFNNIG AGEASDILNT RTKGQKPKLP1500 1501 EKPRFIEVSS NSVSLHFKAW KDGGCPMSHF VVESKKRDQI EWNQISNNVK PDNNYVVLDL1560 1561 EPATWYNLRI TAHNSAGFTV AEYDFATLTV TGGTIAPLDD GSGHGNVHTR IRLPAWMPEW1620 1621 LDLNFMVPLI ATVVVVAVGI CVVCVALSRR RADDMRGGQK DVYYDVVYNQ TMGPGATLDK1680 1681 RRPDLRDELG YIAPPNRKLP PVPGSNYNTC DRIKRGRGGL RSNHSTWDPR RNPNLYEELK1740 1741 APPVPMHGNH YGHAHGNAEC HYRHPGMEDE ICPYATFHLL GFREEMDPTK AMNFQTFPHQ1800 1801 NGHAGPVPGH AGTMLPPGHP GHVHSRSGSQ SMPRANRYQR KNSQGGQSSI YTPAPEYDDP1860 1861 ANCAEEDQYR RYTRVNSQGG SLYSGPGPEY DDPANCAPEE DQYGSQYGGP YGQPYDHYGS1920 1921 RGSMGRRSIG SARNPGNGSP EPPPPPPRNH DMSNSSFNDS KESNEISEAE CDRDHGPRGN1980 1981 YGAVKRSPQP KDQRTTEEMR KLIERNETGP KQLQLQQANG AGFTAYDTMA V |
SHOWING SINGLE HITS. [ Hide Single Hits ]
New Feature: Upload Your Own Microscopy Data
Domains predicted:
# | Region(s) | Method | Confidence | Match Description | |
1 | View Details | [1..138] | 79.0 | No description for 2v5sA was found. | |
2 | View Details | [139..235] | 20.154902 | No description for 2ec8A was found. | |
3 | View Details | [236..895] | 58.0 | Model of human carcinoembryonic antigen by homology modelling and curve-fitting to experimental solution scattering data | |
4 | View Details | [896..1012] | 37.39794 | No description for 2nziA was found. | |
5 | View Details | [1013..1109] | 9.154902 | No description for 2edxA was found. | |
6 | View Details | [1110..1213] | 13.0 | The solution structure of the third fibronectin type III domain of human Neogenin | |
7 | View Details | [1214..1306] | 14.69897 | Structural basis for the interactions between tenascins and the C-type lectin domains from lecticans: evidence for a cross-linking role for tenascins | |
8 | View Details | [1307..1599] | 9.39794 | Interleukin-6 receptor alpha chain, N-teminal domain; Interleukin-6 receptor alpha chain, domains 2 and 3 | |
9 | View Details | [1600..1843] | N/A | No confident structure predictions are available. | |
10 | View Details | [1844..2031] | 2.104993 | View MSA. No confident structure predictions are available. |
Functions predicted (by domain):
# | Gene Ontology predictions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6 |
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7 |
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8 |
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9 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10 | No functions predicted. |
Source: Reynolds et al. 2008. Manuscript submitted |