General Information: |
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Name(s) found: |
Dscam-PAX /
FBpp0110364
[FlyBase]
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Description(s) found:
SHOW ONLY BEST |
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Organism: | Drosophila melanogaster |
Length: | 2019 amino acids |
Gene Ontology: |
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Cellular Component: |
integral to plasma membrane
[ISS]
dendrite [IDA] neuronal cell body [IDA] axon [IDA] |
Biological Process: |
mushroom body development
[IMP]
dendrite self-avoidance [IDA][IMP] phagocytosis [IMP] axon guidance [IGI][IMP][TAS] peripheral nervous system development [IMP] neuron development [IMP] central nervous system morphogenesis [IMP] axonal fasciculation [IMP] axon extension involved in axon guidance [IMP] |
Molecular Function: |
protein binding
[IDA]
protein homodimerization activity [IPI] axon guidance receptor activity [IMP][NAS] bacterial cell surface binding [IDA] |
Sequence: |
|
Sequence: [PDR BLAST] [ProtParam] |
1 11 21 31 41 51 | | | | | | 1 MNMPNERLKW LMLFAAVALI ACGSQTLAAN PPDADQKGPV FLKEPTNRID FSNSTGAEIE 60 61 CKASGNPMPE IIWIRSDGTA VGDVPGLRQI SSDGKLVFPP FRAEDYRQEV HAQVYACLAR 120 121 NQFGSIISRD VHVRAVVHQF YQTRVIDEFV LRGNSATLKC LVPSFVADFI DVEGWIDEEG 180 181 VEILRPLPDD SVDGKYLVLP SGELHIREVG PEDGYKSYQC RTKHRLTGET RLSATKGRLV 240 241 ITEPIGARAP TFSTDSNSFS YTRSVGQSFA LLCQAQAYPV PIMRWYKFIE GTTRKQAVVL 300 301 NDRVKQVSGT LIIKDAVVED SGKYLCVVNN SVGGESVETV LTVTAPLSAK IDPPTQTVDF 360 361 GRPAVFTCQY TGNPIKTVSW MKDGKAIGHS EPVLRIESVK KEDKGMYQCF VRNDQESAEA 420 421 SAELKLGGRF DPPVIRQAFQ EETMEPGPSV FLKCVAGGNP TPEISWELDG KKIANNDRYQ 480 481 VGQYVTVNGD VVSYLNITSV HANDGGLYKC IAKSKVGVAE HSAKLNVYGL PYIRQMEKKA 540 541 IVAGETLIVT CPVAGYPIDS IVWERDNRAL PINRKQKVFP NGTLIIENVE RNSDQATYTC 600 601 VAKNQEGYSA RGSLEVQVMV PPKITPFDFG DAPTNVEDSV SVMCLISNGD LPIDIEWFFN 660 661 DYGISSYSGI NVVKGGKRNS MLSIDSVQAR HAGKYSCRAK NHAAAVNYTT ELIVNVPPRW 720 721 ILEPTDKAFA QGSDAKVECK ADGFPKPQVT WKKAVGDTPG EYKDLKKSDN IRVEEGTLHV 780 781 DNIQKTNEGY YLCEAINGIG SGLSAVIMIS VQAPPEFTEK LRNQTARRGE PAVLQCEAKG 840 841 EKPIGILWNM NNMRLDPKND NRYTIREEIL STGVMSSLSI KRTERSDSAL FTCVATNAFG 900 901 SDDASINMIV QEVPEMPYAL KVLDKSGRSV QLSWAQPYDG NSPLDRYIIE FKRSRASWSE 960 961 IDRVIVPGHT TEAQVQKLSP ATTYNIRIVA ENAIGTSQSS EAVTIITAEE APSGKPQNIK1020 1021 VEPVNQTTMR VTWKPPPRTE WNGEILGYYV GYKLSNTNSS YVFETINFIT EEGKEHNLEL1080 1081 QNLRVYTQYS VVIQAFNKIG AGPLSEEEKQ FTAEGTPSQP PSDTACTTLT SQTIRVGWVS1140 1141 PPLESANGVI KTYKVVYAPS DEWYDETKRH YKKTASSDTV LHGLKKYTNY TMQVLATTAG1200 1201 GDGVRSVPIH CQTEPDVPEA PTDVKALVMG NAAILVSWRP PAQPNGIITQ YTVYSKAEGA1260 1261 ETETKTQKVP HYQMSFEATE LEKNKPYEFW VTASTTIGEG QQSKSIVAMP SDQVPAKIAS1320 1321 FDDTFTATFK EDAKMPCLAV GAPQPEITWK IKGVEFSAND RMRVLPDGSL LIKSVNRQDA1380 1381 GDYSCHAENS IAKDSITHKL IVLAPPQSPH VTLSATTTDA LTVKLKPHEG DTAPLHGYTL1440 1441 HYKPEFGEWE TSEVSVDSQK HNIEGLLCGS RYQVYATGFN NIGAGEASDI LNTRTKGQKP1500 1501 KLPEKPRFIE VSSNSVSLHF KAWKDGGCPM SHFVVESKKR DQIEWNQISN NVKPDNNYVV1560 1561 LDLEPATWYN LRITAHNSAG FTVAEYDFAT LTVTGGTIAP SRDLPELSAE DTIRIILSNL1620 1621 NLVVPVVAAL LVIIIAIIVI CILRSKGNHH KDDVVYNQTM GPGATLDKRR PDLRDELGYI1680 1681 APPNRKLPPV PGSNYNTCDR IKRGRGGLRS NHSTWDPRRN PNLYEELKAP PVPMHGNHYG1740 1741 HAHGNAECHY RHPGMEDEIC PYATFHLLGF REEMDPTKAM NFQTFPHQNG HAGPVPGHAG1800 1801 TMLPPGHPGH VHSRSGSQSM PRANRYQRKN SQGGQSSIYT PAPEYDDPAN CAEEDQYRRY1860 1861 TRVNSQGGSL YSGPGPEYDD PANCAPEEDQ YGSQYGGPYG QPYDHYGSRG SMGRRSIGSA1920 1921 RNPGNGSPEP PPPPPRNHDM SNSSFNDSKE SNEISEAECD RDHGPRGNYG AVKRSPQPKD1980 1981 QRTTEEMRKL IERNETGPKQ LQLQQANGAG FTAYDTMAV |
SHOWING SINGLE HITS. [ Hide Single Hits ]
New Feature: Upload Your Own Microscopy Data
Domains predicted:
# | Region(s) | Method | Confidence | Match Description | |
1 | View Details | [1..143] | 79.69897 | No description for 2v5sA was found. | |
2 | View Details | [144..242] | 13.09691 | Immunoglobulin light chain kappa variable domain, VL-kappa; Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH | |
3 | View Details | [243..898] | 58.522879 | Model of human carcinoembryonic antigen by homology modelling and curve-fitting to experimental solution scattering data | |
4 | View Details | [899..1374] | 27.69897 | No description for 2v5yA was found. | |
5 | View Details | [1375..1595] | 23.30103 | Fibronectin, different Fn3 modules | |
6 | View Details | [1596..1843] | N/A | No confident structure predictions are available. | |
7 | View Details | [1844..2019] | 2.125995 | View MSA. No confident structure predictions are available. |
Functions predicted (by domain):
# | Gene Ontology predictions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | No functions predicted. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
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3 | No functions predicted. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | No functions predicted. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 |
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6 | No functions predicted. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 | No functions predicted. |
Source: Reynolds et al. 2008. Manuscript submitted |