General Information: |
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Name(s) found: |
RAD54_YEAST
[Swiss-Prot]
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Description(s) found: |
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Organism: | Saccharomyces cerevisiae S288c |
Length: | 898 amino acids |
Gene Ontology: |
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Cellular Component: | NONE FOUND |
Biological Process: | NONE FOUND |
Molecular Function: | NONE FOUND |
Sequence: |
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Sequence: [PDR BLAST] [ProtParam] |
1 11 21 31 41 51 | | | | | | 1 MARRRLPDRP PNGIGAGERP RLVPRPINVQ DSVNRLTKPF RVPYKNTHIP PAAGRIATGS 60 61 DNIVGGRSLR KRSATVCYSG LDINADEAEY NSQDISFSQL TKRRKDALSA QRLAKDPTRL 120 121 SHIQYTLRRS FTVPIKGYVQ RHSLPLTLGM KKKITPEPRP LHDPTDEFAI VLYDPSVDGE 180 181 MIVHDTSMDN KEEESKKMIK STQEKDNINK EKNSQEERPT QRIGRHPALM TNGVRNKPLR 240 241 ELLGDSENSA ENKKKFASVP VVIDPKLAKI LRPHQVEGVR FLYRCVTGLV MKDYLEAEAF 300 301 NTSSEDPLKS DEKALTESQK TEQNNRGAYG CIMADEMGLG KTLQCIALMW TLLRQGPQGK 360 361 RLIDKCIIVC PSSLVNNWAN ELIKWLGPNT LTPLAVDGKK SSMGGGNTTV SQAIHAWAQA 420 421 QGRNIVKPVL IISYETLRRN VDQLKNCNVG LMLADEGHRL KNGDSLTFTA LDSISCPRRV 480 481 ILSGTPIQND LSEYFALLSF SNPGLLGSRA EFRKNFENPI LRGRDADATD KEITKGEAQL 540 541 QKLSTIVSKF IIRRTNDILA KYLPCKYEHV IFVNLKPLQN ELYNKLIKSR EVKKVVKGVG 600 601 GSQPLRAIGI LKKLCNHPNL LNFEDEFDDE DDLELPDDYN MPGSKARDVQ TKYSAKFSIL 660 661 ERFLHKIKTE SDDKIVLISN YTQTLDLIEK MCRYKHYSAV RLDGTMSINK RQKLVDRFND 720 721 PEGQEFIFLL SSKAGGCGIN LIGANRLILM DPDWNPAADQ QALARVWRDG QKKDCFIYRF 780 781 ISTGTIEEKI FQRQSMKMSL SSCVVDAKED VERLFSSDNL RQLFQKNENT ICETHETYHC 840 841 KRCNAQGKQL KRAPAMLYGD ATTWNHLNHD ALEKTNDHLL KNEHHYNDIS FAFQYISH |
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Domains predicted:
# | Region(s) | Method | Confidence | Match Description | |
1 | View Details | [1..223] | 1.238994 | View MSA. No confident structure predictions are available. | |
2 | View Details | [224..275] | 13.09 | RecG, N-terminal domain; RecG "wedge" domain; RecG helicase domain | |
3 | View Details | [276..583] | 13.09 | RecG, N-terminal domain; RecG "wedge" domain; RecG helicase domain | |
4 | View Details | [584..640] | 8.221849 | Putative DEAD box RNA helicase | |
5 | View Details | [641..898] | 7.045757 | Nucleotide excision repair enzyme UvrB |
Functions predicted (by domain):
# | Gene Ontology predictions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | No functions predicted. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
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3 |
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4 | No functions predicted. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | No functions predicted. |
Protein predicted to be: | GLOBULAR (No transmembrane regions or signal peptide) |
Confidence of classification: | 0.99 |
Source: Reynolds et al. (2008)