YRC Logo
PROTEIN SEARCH:
Descriptions Names[Advanced Search]

View Philius Transmembrane Prediction Details

Prediction Overview

Protein: SPBC1289.15
Protein type: Globular with Signal Peptide
Type Confidence: 0.81
From Publication: Reynolds et al. (2008)


Predicted Protein Segments [Show List]:

Prediction Image Map

(Place mouse over segments for confidence values.)


Philius confidence legend

Prediction Sequence Map

Legend: Transmembrane Helix, Non-Cytoplasmic, Cytoplasmic, Signal Peptide

(Place mouse over sequence for confidence values.)

      1          11         21         31         41         51         
      |          |          |          |          |          |          
    1 MLVFTDLIFL AIFAHIGKAT AKVWNRNVQG FLDLNLPNEC SQYTTIYSDG PSEYTSTLPY  60
   61 THSFSNASVY TTLITITNSQ CTGNYSTLTI SSQPLIHTNT SISKPSQTAT PQNTNTTQVS 120
  121 LTNGTTTNSY SNTNSLPITD TINGTTELII PTTSYNNQSH TLIYSTYTST YLPNSTIDLS 180
  181 ILPHSTISTL STVSINDTSA SLSKTTSPTA GTITETIVSG SVGYTSTFPA SGTTSGTVEV 240
  241 VEPTAGTITE TIVSGSVGYT STFPANGTTS GTVEVVEPTA GTITETIVSG SVGYTSTFPA 300
  301 NGTTSGTVEV VEPTAGTITE TIVSGSVGYT STFPANGTTS GTVEVVEPTA GTVTETIVSG 360
  361 SVGYTSTFPA SGTTSGTVEV VEPTAGTITE TIVSGSKAFT STFPANGTTS GTVEVVEPTA 420
  421 GTITKTIVSG SKTFTSTFPA NGTTSGTVEV VEPTAGTITE TIVSGSVGYT STFPANGTTS 480
  481 GTVEVVEPTA GTITETIVSG SKTFTSTFPA SGTTSGTVEV VEPTAGTITE TIVSGSKAFT 540
  541 STFPANGTTS GTVEVVEPTA GTITETIVSG SVGYTSTFPA SGTTSGTVEV VEPTAGTVTE 600
  601 TIVSGSVGYT STFPASGTTS GTVEVVEPTA GTVTETIVSG SVGYTSTFPA SGTTSGTVEV 660
  661 VEPTAGTITE TIVSGSKAFT STFPANGTTS GTVEVVEPTA GTITETIVSG SKTFTSTFPA 720
  721 NGTTSGTVEV VEPTAGTITE TIVSGSVGYT STFPASGTTS GTVEVVEPTA GTVTETVISG 780
  781 SVSFMSTITA HDTSSGAVIV VEPTAGTVTE TIVSGSIPFT STIPAQGTTS GTVEVVEPTA 840
  841 GTVTETIISG SVGYTSTFPA QGTTSGTVEV VEPTAGTVTE TIISGSVGYT STFPAQGTTS 900
  901 GTVEIVAPTA GTVTETIVSG SIPFTSTIPA QGTTSGTVEV VEPTAGTVTE TIISGSVGYT 960
  961 STFPAQGTTS GTVEIVAPTA GTVTETIVSG SIPFTSTIPA QGTTSGTVEV VEPTAGTVTE1020
 1021 TIISGSVGYT STFPAQGTTS GTVEVVEPTA GTVTETIVSG SIPFTSTIPA QGTTSGTVEI1080
 1081 VVPTAGTVTS TTGSGTSWFT TTVPATGTRS GSVIVVSPTA PACSSTPFAE CPNLNFNFHS1140
 1141 KNVNFPPADI RVISVTPKGN NMYDATVQFT TSSTMSKKSL SELKILGLSQ TYLLYSYNSK1200
 1201 VDNISNPGSW TSTVTVQGTS TGSYICMPHF QIQYDWCSAG VTDMSECNTW SYQKSYDYIT1260
 1261 GCNNYDNQGN SQTDASDYCW NVC

YRC Informatics Platform - Version 3.0
Created and Maintained by: Michael Riffle