YRC Logo
PROTEIN SEARCH:
Descriptions Names[Advanced Search]

View Philius Transmembrane Prediction Details

Prediction Overview

Protein: FP1_MYTGA
Protein type: Globular with Signal Peptide
Type Confidence: 0.72
From Publication: Reynolds et al. (2008)


Predicted Protein Segments [Show List]:

Prediction Image Map

(Place mouse over segments for confidence values.)


Philius confidence legend

Prediction Sequence Map

Legend: Transmembrane Helix, Non-Cytoplasmic, Cytoplasmic, Signal Peptide

(Place mouse over sequence for confidence values.)

      1          11         21         31         41         51         
      |          |          |          |          |          |          
    1 MEGIKLNLCL LCIFTCDILG FSNGNIYNAH GSAYAGASAG AYKTLPNAYP YGTKHGPVYK  60
   61 PVKTSYHPTN SYPPTYGSKT NYLPLAKKLS SYKPIKTTYN AKTNYPPVYK PKMTYPPTYK 120
  121 PKPSYPPTYK PKPSYPATYK SKSSYPSSYK PKKTYPPTYK PKLTYPPTYK PKPSYPPTYK 180
  181 PKPSYPATYK SKSSYPPSYK TKKTYPSSYK PKKTYPSTYK PKVSYPPTYK SKKSYPPIYK 240
  241 TKASYPSSYK PKKTYPSTYK PKISYPPTYK AKPSYPTSYR AKPSYPSTYK AKPSYPPTYK 300
  301 AKPSYPPTYK AKPTYPSTYK AKPSYPPTYK AKPSYPPTYK AKPSYPPSYK PKTTYPPSYK 360
  361 PKISYPPTYK AKPSYPPIYK AKPSYPPTYK AKPSYLPTYK AKPSYPPTYK AKPRYPTTYK 420
  421 AKPSYPPTYK AKPSYPPTYK AKLSYPPTYK AKPSYPPTYK AKPSYPPTYK AKPSYPPTYK 480
  481 TKPSYPRTYK AKPSYSSTYK AKPSYPPTYK AKPSYPPTYK AKPSYPPTYK AKPSYPPTYK 540
  541 AKPSYPPTYK AKPSYPQTYK AKSSYPPTYK AKPSYPPTYK AKPSYPPTYK AKPSYPPTYK 600
  601 AKPSYPPTYK AKPSYPPTYK AKPSYPPTYK AKPSYPPTYK AKPSYPPTYK AKPSYPATYP 660
  661 STYKAKPSYP PTYKAKPSYP PTYKPKPSYP PTYKSKSSYP SSYKPKKTYP PTYKPKLTYP 720
  721 PIYKPKPSYP PTYKSSYPPR YKKKISYPSQ Y

YRC Informatics Platform - Version 3.0
Created and Maintained by: Michael Riffle