YRC Logo
PROTEIN SEARCH:
Descriptions Names[Advanced Search]

View Philius Transmembrane Prediction Details

Prediction Overview

Protein: gi|9294269, gi|1...
Protein type: Globular with Signal Peptide
Type Confidence: 0.46
From Publication: Reynolds et al. (2008)


Predicted Protein Segments [Show List]:

Prediction Image Map

(Place mouse over segments for confidence values.)


Philius confidence legend

Prediction Sequence Map

Legend: Transmembrane Helix, Non-Cytoplasmic, Cytoplasmic, Signal Peptide

(Place mouse over sequence for confidence values.)

      1          11         21         31         41         51         
      |          |          |          |          |          |          
    1 MGPSAHLVYA IGVIIMATMV AAYEPYTDSS PPPYSVPLPK VEYKSPPLPD VYSSPPPPLE  60
   61 YSPAPKVDYK SPPPPYYSPS PKVEYKSPPP PYVYNSPPPP YYSPSPKVDY KSPPPPYVYS 120
  121 SPPPPIYSPS PKVDYKSPPP PYVYSSPPPP YYSPSPKVEY KSPPSPYVYN SPPPSYYSPS 180
  181 PKVDYKSPPP PYVYSSPPPP YYSPSPKVVY KSPPPPYVYS SPPPPYYSPS PKVDYKSPPP 240
  241 PYVYSSPPPP YYSPSPKIVY KSPPPPYVYS SPPPPYYSPS PKVDYKSPPP PYVYSSPPPP 300
  301 YYSPSPKVVY KSPPPPYVYS SPPPPYYSPT PKVDYKSPPP PYVYSSPPPP YYSPSPKVDY 360
  361 KSPPPPYVYS SPPPPYYSPS PKIVYKSPPP PYVYSSPPPP YYTPSPKVVY KSPPPPYVYS 420
  421 SPPPPYYSPS PKVDYKSPPP PYVYSSPPPP YYSPSPKVVY KSPPPPYVYS SPPPPYYSPS 480
  481 PKVDYKSPPP PYVYSSPPPP YYSPSPKVLY KSPPPPYVYS SPPPPYYSPS PKVVYKSPPP 540
  541 PYVYSSPPPP YYSPSPKVVY KSPPPPYVYS SPPPPYYSPS PKVVYKSPPP PYVYSSPPPP 600
  601 YYSPSPKVYY KSPPSPYHAP SPKVLYKSPP HPHVCVCPPP PPCYSPSPKV VYKSSPPPYV 660
  661 YSSPPPPYHS PSPKVHYKSP PPPYVYSSPP PPYYSPSPKV HYKSPPPPYV YSSPPPPYYS 720
  721 PSPKVVYKSP PPPYVYSSPP PPYYSPSPKV VYKSPPPPYV YSSPPPPYYS PSPKVVYKSP 780
  781 PPPYVYSSPP PPYYSPSPKV VYKSPPPPYV YSSPPPPYYS PSPKVVYKSP PPPYVYSSPP 840
  841 PPYYSPSPKV VYKSPPPPYV YSSPPPPYYS PSPKVDYKSP PPPYVYSSPP PPYYSPSPKV 900
  901 DYKSPPPPYV YSSPPPPYYS PSPKVDYKSP PPPYVYSSPP PPYYSPAPKV DYKSPPPPYV 960
  961 YSSPPPPYYS PSPKVDYKSP PPPYYSPSPK VDYKSPPPPY VYSSPPPPSY SPSPKTEY

YRC Informatics Platform - Version 3.0
Created and Maintained by: Michael Riffle