YRC Logo
PROTEIN SEARCH:
Descriptions Names[Advanced Search]

View Philius Transmembrane Prediction Details

Prediction Overview

Protein: EXTN2_ARATH
Protein type: Globular with Signal Peptide
Type Confidence: 0.97
From Publication: Reynolds et al. (2008)


Predicted Protein Segments [Show List]:

Prediction Image Map

(Place mouse over segments for confidence values.)


Philius confidence legend

Prediction Sequence Map

Legend: Transmembrane Helix, Non-Cytoplasmic, Cytoplasmic, Signal Peptide

(Place mouse over sequence for confidence values.)

      1          11         21         31         41         51         
      |          |          |          |          |          |          
    1 MGPSAHLISA LGVIIMATMV AAYEPETYAS PPPLYSSPLP EVEYKTPPLP YVDSSPPPTY  60
   61 TPAPEVEYKS PPPPYVYSSP PPPTYSPSPK VDYKSPPPPY VYSSPPPPYY SPSPKVDYKS 120
  121 PPPPYVYNSP PPPYYSPSPK VDYKSPPPPY VYSSPPPPYY SPSPKVEYKS PPPPYVYSSP 180
  181 PPPYYSPSPK VDYKSPPPPY VYSSPPPPYY SPSPKVEYKS PPPPYVYSSP PPPYYSPSPK 240
  241 VDYKSPPPPY VYSSPPPPYY SPSPKVDYKS PPPPYVYSSP PPPYYSPSPK VDYKSPPPPY 300
  301 VYSSPPPPYY SPSPKVDYKS PPPPYVYSSP PPPYYSPSPK VDYKSPPPPY VYSSPPPPTY 360
  361 SPSPKVDYKS PPPPYVYSSP PPPYYSPSPK VEYKSPPPPY VYSSPPPPTY SPSPKVYYKS 420
  421 PPPPYVYSSP PPPYYSPSPK VYYKSPPPPY VYSSPPPPYY SPSPKVYYKS PPPPYVYSSP 480
  481 PPPYYSPSPK VYYKSPPPPY VYSSPPPPYY SPSPKVYYKS PPPPYVYSSP PPPYYSPSPK 540
  541 VHYKSPPPPY VYSSPPPPYY SPSPKVHYKS PPPPYVYNSP PPPYYSPSPK VYYKSPPPPY 600
  601 VYSSPPPPYY SPSPKVYYKS PPPPYVYSSP PPPYYSPSPK VYYKSPPPPY YSPSPKVYYK 660
  661 SPPHPHVCVC PPPPPCYSPS PKVVYKSPPP PYVYNSPPPP YYSPSPKVYY KSPPPPSYYS 720
  721 PSPKVEYKSP PPPSYSPSPK TEY

YRC Informatics Platform - Version 3.0
Created and Maintained by: Michael Riffle