YRC Public Data Repository - View Philius Transmembrane Prediction Details

Prediction Overview

Protein:	CG32642-PC
Protein type:	Globular with Signal Peptide
Type Confidence:	0.98
From Publication:	Reynolds et al. (2008)

Predicted Protein Segments [Show List]:

Prediction Image Map

(Place mouse over segments for confidence values.)

Prediction Sequence Map

Legend: Transmembrane Helix, Non-Cytoplasmic, Cytoplasmic, Signal Peptide

(Place mouse over sequence for confidence values.)

      1          11         21         31         41         51         
      |          |          |          |          |          |          
    1 MFHPRSQSSS LALLLTFVLA FVGVKGDYDW YSDYSGSELD YIFADVNYDA VCPPGGYAVC  60
   61 ATDGYSYHPF SSKCRLDSQN LKLLFAGKKE LIQTDLSYCP SYPPRPYGPP APAYGYQSKP 120
  121 VQNYAPVRYS SSSGQNSYAY AAASGPYGAK AVAEAPGPYP VASPSYSVSY PAAPAAYAPP 180
  181 PPKYPSPPSS YPVYAKPVPA YAAVYSYADT TKAPSTGSTT ASATTGTTKS NRYPGYPTKY 240
  241 ATTTAATTTA ATTTAATTTA ATTTAATTTA ATTTAATTTA ATTTAATTTA ATTTAATTTA 300
  301 ATTTAATTTA ATTTAATTAA TTTAATTTAA TTTAATTTAA TTTAATTTAA TTTAATTTAA 360
  361 TTTAATTAAP SVSRIPSNTE I

Type	Start	End	Confidence
Signal Peptide	1	26	0.98
N-region	1	17
H-region	18	23
C-region	24	26
Cleavage Site	26	27
Non-Cytoplasmic	27	381	0.99