YRC Logo
PROTEIN SEARCH:
Descriptions Names[Advanced Search]

View Philius Transmembrane Prediction Details

Prediction Overview

Protein: gi|5031925, gi|1...
Protein type: Globular with Signal Peptide
Type Confidence: 0.99
From Publication: Reynolds et al. (2008)


Predicted Protein Segments [Show List]:

Prediction Image Map

(Place mouse over segments for confidence values.)


Philius confidence legend

Prediction Sequence Map

Legend: Transmembrane Helix, Non-Cytoplasmic, Cytoplasmic, Signal Peptide

(Place mouse over sequence for confidence values.)

      1          11         21         31         41         51         
      |          |          |          |          |          |          
    1 MAWKTLPIYL LLLLSVFVIQ QVSSQDLSSC AGRCGEGYSR DATCNCDYNC QHYMECCPDF  60
   61 KRVCTAELSC KGRCFESFER GRECDCDAQC KKYDKCCPDY ESFCAEVHNP TSPPSSKKAP 120
  121 PPSGASQTIK STTKRSPKPP NKKKTKKVIE SEEITEEHSV SENQESSSSS SSSSSSSTIW 180
  181 KIKSSKNSAA NRELQKKLKV KDNKKNRTKK KPTPKPPVVD EAGSGLDNGD FKVTTPDTST 240
  241 TQHNKVSTSP KITTAKPINP RPSLPPNSDT SKETSLTVNK ETTVETKETT TTNKQTSTDG 300
  301 KEKTTSAKET QSIEKTSAKD LAPTSKVLAK PTPKAETTTK GPALTTPKEP TPTTPKEPAS 360
  361 TTPKEPTPTT IKSAPTTPKE PAPTTTKSAP TTPKEPAPTT TKEPAPTTPK EPAPTTTKEP 420
  421 APTTTKSAPT TPKEPAPTTP KKPAPTTPKE PAPTTPKEPT PTTPKEPAPT TKEPAPTTPK 480
  481 EPAPTAPKKP APTTPKEPAP TTPKEPAPTT TKEPSPTTPK EPAPTTTKSA PTTTKEPAPT 540
  541 TTKSAPTTPK EPSPTTTKEP APTTPKEPAP TTPKKPAPTT PKEPAPTTPK EPAPTTTKKP 600
  601 APTAPKEPAP TTPKETAPTT PKKLTPTTPE KLAPTTPEKP APTTPEELAP TTPEEPTPTT 660
  661 PEEPAPTTPK AAAPNTPKEP APTTPKEPAP TTPKEPAPTT PKETAPTTPK GTAPTTLKEP 720
  721 APTTPKKPAP KELAPTTTKE PTSTTSDKPA PTTPKGTAPT TPKEPAPTTP KEPAPTTPKG 780
  781 TAPTTLKEPA PTTPKKPAPK ELAPTTTKGP TSTTSDKPAP TTPKETAPTT PKEPAPTTPK 840
  841 KPAPTTPETP PPTTSEVSTP TTTKEPTTIH KSPDESTPEL SAEPTPKALE NSPKEPGVPT 900
  901 TKTPAATKPE MTTTAKDKTT ERDLRTTPET TTAAPKMTKE TATTTEKTTE SKITATTTQV 960
  961 TSTTTQDTTP FKITTLKTTT LAPKVTTTKK TITTTEIMNK PEETAKPKDR ATNSKATTPK1020
 1021 PQKPTKAPKK PTSTKKPKTM PRVRKPKTTP TPRKMTSTMP ELNPTSRIAE AMLQTTTRPN1080
 1081 QTPNSKLVEV NPKSEDAGGA EGETPHMLLR PHVFMPEVTP DMDYLPRVPN QGIIINPMLS1140
 1141 DETNICNGKP VDGLTTLRNG TLVAFRGHYF WMLSPFSPPS PARRITEVWG IPSPIDTVFT1200
 1201 RCNCEGKTFF FKDSQYWRFT NDIKDAGYPK PIFKGFGGLT GQIVAALSTA KYKNWPESVY1260
 1261 FFKRGGSIQQ YIYKQEPVQK CPGRRPALNY PVYGEMTQVR RRRFERAIGP SQTHTIRIQY1320
 1321 SPARLAYQDK GVLHNEVKVS ILWRGLPNVV TSAISLPNIR KPDGYDYYAF SKDQYYNIDV1380
 1381 PSRTARAITT RSGQTLSKVW YNCP

YRC Informatics Platform - Version 3.0
Created and Maintained by: Michael Riffle