YRC Logo
PROTEIN SEARCH:
Descriptions Names[Advanced Search]

View Philius Transmembrane Prediction Details

Prediction Overview

Protein: Muc12Ea-PA
Protein type: Globular with Signal Peptide
Type Confidence: 0.98
From Publication: Reynolds et al. (2008)


Predicted Protein Segments [Show List]:

Prediction Image Map

(Place mouse over segments for confidence values.)


Philius confidence legend

Prediction Sequence Map

Legend: Transmembrane Helix, Non-Cytoplasmic, Cytoplasmic, Signal Peptide

(Place mouse over sequence for confidence values.)

      1          11         21         31         41         51         
      |          |          |          |          |          |          
    1 MQLFVICLLV ASTAAFTMFG PHIRIVPGQK PNEIVLHFRN PCNNKTSTTT LKPPPPPCPS  60
   61 HPTTPACEHR ITSPAPTKPH CPHATATPHN CGHDTTSSSR ATTPKPTLET TIGTTFKTTQ 120
  121 ITTRGPTTQK PTEGTSAQPT TLKPTEGTTA KPTTLKPTEG TTAKPTTLKP TEGTSAKPTT 180
  181 LKPTEGTTAK PTTLKPTEGT SAKPTTLKPT EGTTAKPTTL KPTEGTTAKP TTLKPTEGTT 240
  241 AKPTTLKPTE GTSAKPTTLK PTEGTTAKPT TLKPTEGTSA KPTTLKPTEG TTAKPTTLKP 300
  301 TEGTTAKPTT LKPTEGTSAK PTTLKPTEGT TAKPTTLKPT EGTSAKPTTL KPTEGTTAKP 360
  361 TTLKPTEGTS AKPTTLKPTE GTSAKPTTLK PTEGTSAKPT TLKPTEGTSA KPTTLKPTEG 420
  421 TSAKPTTLKP TAGTTAKPTT LKPTEGTSAK PTTLKPTEGT TAKPTTLKPT EGTTAKPTTL 480
  481 KPTEGTSAKP TTLKPTEGTT AKPTTLKPTE GTSAQPTTLK PTEGTTAKPT TLKPTEGTSA 540
  541 QPTTLKPTKG TTAKPTTLKP TEGTSAKPTT LKPTEGTTAK PTTLKPTEGT SAKPTTLKPT 600
  601 EGTTAKPTTL KPTEGTSAQP TTLKPTKGTT AKPTTLKPTE GTSAKPTTLK PTDGTTAKPT 660
  661 TLKPTEGTSA KPTTLKPTEG TTAKPTTLKP TEGTSAKPTT LKPTDGTTAK PTTLKLTEGT 720
  721 SAKPTTLKPT EGTTAKPTTL KPTEGTSAQP TTLKPTEGTT AKPTTLKPTE GTSAQPTTLK 780
  781 PTKGTTAKPT TLKPTEGTSA KPTTLKPTEG TTAKPTTLKP TEGTSAKPTT LKPTEGTTAK 840
  841 PTTLKPTEGT TAKPTTLKPT DGTTAKPTTL KPTEGTSAKP TTLKPTEGTT AKPTTLKPTE 900
  901 GTTAKPTTLK PTDGTTAKPT TLKPTEGTSA KPTTLKPTDG TTAKSTTLKP TEGTSAKPTT 960
  961 LKPTEGTTAK PTTLKPTEGT TAKPTTLKPT EGTSAKPTTL KPTEGTTAKP TTLKPTEGTS1020
 1021 AQPTTLKPTE GTSAKPTTLK PTDGTTAKPT TLKPTEGTSA KPTTLKPTEG TTAKPTTLKP1080
 1081 TEGTSAKPTT LKPTEGTTAK PTTLKPTEGT TAKPTTLKPT EGTTAKPTTL KPTEGTSAKP1140
 1141 TTLKPTEGTT AKPTTLKPTE GTTAKPTTLK PTEGTSGTTA KPTTLKPTEG TTAKPTTLKP1200
 1201 TKGTTAKSTT LKPTEGTSAK PTTLKPTEGT TAKPTTLKPT EGTSAKPTTL KPTEGTTAKP1260
 1261 TTLKPTEGTT AKPTTLKPTE GTSAKPTTLK PTEGTTAKPT TLKPTEGTSA KPTTLKPTEG1320
 1321 TTAKPTTLKP TEGTTAKPTT LKPTEGTTAK PTTLKPTEGT SGTSAKPTTL KPTEGTTAKP1380
 1381 TTLKPTEGTS AKPTTLKPTE GTTAKPTTLK PTEGTTAQPT TLKPTEGTTA KPTTLKPTEG1440
 1441 TSAQPTTLKP TEGTTAKPTT LKPTEGTSAK PTTLKPTEGT TAKPTTLKPT EGTSAQPTTL1500
 1501 KPTEGTSAQS TTLKPTEGTT AKPTTLKPTE GTSAKPTTLK PTEGTTAKPT TLKPTEGTSA1560
 1561 KPTTLKPTEG TTAKPTTLKP TEGTTAKPTT LKPTEGTSAK PTTLKPTEGT SAKPTTLKPT1620
 1621 EGTSAKPTTL KPTEGTSAQP TTLKPTEGTS AKPTTLKPTE GTTAKPTTLK PTDGTTAKPT1680
 1681 TLKPTEGTSA KPTTLKPTEG TTAKPTTLKP TEGTSAKPTT LKPTEGTTAK PTTLKPTEGT1740
 1741 SAQPTTLKPT ERTSAQPTTL KPTEGTTAKP TTLKPTEGTS AQPTTLKPTE GTTAKPTTLK1800
 1801 PTEGTSAKPT TLKPTEGTTA KPTTLKPTEG TSAKPTTLKP TEGTTAKPTT LKPTDGTTAK1860
 1861 PTTLKPTEGT SAKPTTLKPT EGTTAKPTTL KPTEGTSAKP TTLKPTEGTT AKPTTLKPTE1920
 1921 GTSANAQPTT LKPTEGTTAK PTTLKPTKGT SAKPTTLKPT EGTTAKPTTL KPTEGTTAKP1980
 1981 TTLKPTEGTS AKPTTLKPTE GTTAKPTTLK PTEGTSAQPT TLKPTEGTTA KPTTLKPTEG2040
 2041 TSAKPTTLKP TEGTTAKPTT LKPTEGTSAK PTTLKPTEGT TAKPTTLKPT EGTSAKPTSL2100
 2101 KPTEGTTAKP TTLKPTEGTT AKPTTLKPTD GTSAKPTTLK PTEGTSAQPT TLKPTEGTTA2160
 2161 KPTTLKPTEG TTAKPTTLKP TEGTSAQPTT LKPTEGTTAK PTTLKPTEGT SAKPTTLKPT2220
 2221 EGTTAKPTTL KPTEGTSAKP TTLKPTEGTT AKPTTLKPTE GTSAKPTTLK PTDGTTAKPT2280
 2281 TLKPTEGTSA KPTTLKPTEG TTAKPTTLKP TEGTSAKPTT LKPTDGTTAK PTTLKPTEGT2340
 2341 SAKPTTLKPT EGTTAKPTTL KPTEGTSAKP TTLKPTEGTS AKPTTLKPTE GTTAKPTTLK2400
 2401 PTEGTSAKPT TLKPTEGTTA KPTTLKPTDG TTAKPTTLKP TEGTSAKPTT LKPTEGTTAK2460
 2461 PTTLKPTEGT SAKPTTLKPT EGTTAKPTTL KPTEGTSAQP TTLKPTERTS AQPTTLKPTE2520
 2521 GTTAKPTTLK PTEGTSAQPT TLKPTERTSA QPTTLKPTEG TTAKPTTLKP TKGTSAKPTT2580
 2581 LKPTEGTTAK PTTLKPTEGT TAKPTTLKPT EGTSAKPTTL KPTEGTTAKP TTLKPTDGTT2640
 2641 AKPTTLKPTE GTSAKPTTLK PTEGTTAKPT TLKPTEGTSA KPTTLKPTEG TTAKPTTLKP2700
 2701 TEGTSAKPTT LKPTEGTTAK PTTLKPTDGT TAKPTTLKPT EGTSAKPTTL KPTEGTTAKP2760
 2761 TTLKPTEGTT AKPTTLKPTE GTSAKPTTLK PTEGTTAKPT TLKPTEGTTA KPTTLKPTEG2820
 2821 TSAKPTTLKP TEGTTAKPTT LKPTEGTSAK PTTLKPTEGT TAKPTTLKPT EGTSAKPTTL2880
 2881 KPTEGTTAKP TTLKPTEGTS AKPTTLKPTE GTTAKPTTLK PTEGTSAKPT TLKPTEGTTA2940
 2941 KPTTLKPTEG TTAKPTTLKP TDGTTAKPTT LKPTEGTSAK PTTLKPTEGT TAKPTTLKPT3000
 3001 EGTSAKPTTL KPTEGTTAKP TTLKPTEGTS AQPTTLKPTD GTTAKPTTLK PTEGTSAKPT3060
 3061 TLKPTEGTTA KPTTLKPTEG TSAQPTTLKP TDGTTAKPTT LKPTEGTSAK PTTLKPTEGT3120
 3121 TAKPTTLKPT EGTTAKPTTL KPTEGTSAKP TTLKPTEGTT AKPTTLKPTE GTSAKPTTLK3180
 3181 PTEGTTAKPT TLKPTEGTSA KPTTLKPTEG TTAKPTTLKP TDGTTPERTS QKTTTLKPTS3240
 3241 EKTTTESLPP FNIFDVITGT PLPSTLNIS

YRC Informatics Platform - Version 3.0
Created and Maintained by: Michael Riffle