YRC Logo
PROTEIN SEARCH:
Descriptions Names[Advanced Search]

View Philius Transmembrane Prediction Details

Prediction Overview

Protein: Sgs1-PA
Protein type: Globular with Signal Peptide
Type Confidence: 0.97
From Publication: Reynolds et al. (2008)


Predicted Protein Segments [Show List]:

Prediction Image Map

(Place mouse over segments for confidence values.)


Philius confidence legend

Prediction Sequence Map

Legend: Transmembrane Helix, Non-Cytoplasmic, Cytoplasmic, Signal Peptide

(Place mouse over sequence for confidence values.)

      1          11         21         31         41         51         
      |          |          |          |          |          |          
    1 MKVALIFLTV SILLIQVKNV KANYDWDSMQ DGPSEEIIPG CGGDTIYYPD PVQPCDTDSN  60
   61 PTTTKPRQKT KRPKSTRRTT KRTKRPRRKT TKWTTKRATK RTTKRTTRRR PTTPKTPDTT 120
  121 DSPITTTGAE CTCSDRTTAS STDSTTDRTT VTNTDWTTPL CTDTPPCTCS EESSTAIPSS 180
  181 PCIDTSTVIP TSPCTQETTT PTPTCSTQGT QTTPCTCAQT TTTPRSTTTT STSRPTTTTP 240
  241 RSTTTTTTSR PTTTTPRSTT TTTTRRPTTT TPRCTTTTST CAPTTTTPRS TTTTTTSRPT 300
  301 TTTPRCTTTT STCSPTRTTP RSTTTTSTSR PTTTTPRCTT TPSTSRPTTT TPRSTTKTST 360
  361 CAPTTTTPRP TTTPSTSRPT TTTPRSTTTT STSRPTTTTP RSTTTTTTRR PTTTTPRSTT 420
  421 TTSTSRPTTT TPRSTTTTTT SRPTTTTPRS TTTTCTCSPT TTTPRSTTTT STSRPTTTTP 480
  481 RSTTTTSTSG PTTTTPRSTT TTTTSGPTTT TPRSTTTTCT CSPTTTTPRS TTTPSTSRPT 540
  541 TTTPRSTTTT CTCSPTTTTP RSTTTTSTSR PTTTTPRSTT TTTTSRPTTT TPRSTTTTST 600
  601 SGPTTTTPRS TTTTSTSGPT TTTPRSTTTT STSGPTTTTP RSTTTTSTSG PTTTTPRSTT 660
  661 TTSTSGPTTT TPRSTTTTST SGPTTTTPRS TTTTSTSGPT TTTPRSTTTT STSGPTTTTP 720
  721 RSTTTTSTSG PTTTTPRSTT TTSTSGPTTT TPRSTTTTST SGPTTTTPRS TTTTSTSGPT 780
  781 TTTPRSTTTT STSGPTTTTP RSTTTTSTSG PTTTTPRSTT TTSTSGPTTT TPRSTTTTST 840
  841 SGPTTTTPRS TTTTSTSGPT TTTPRSTTTT STSGPTTTTP RSTTTTSTSG PTTTTPRSTT 900
  901 TTSTSGPTTT TPRSTTTTST SCPTTTTPRS TTTTCTSGPT TTTPRSTTTT CTSCPTTTTP 960
  961 RSTTTTCTSC PTTTTPRSTT TTCTSGPTTT TPRSTTKTST CAPTTTTPRS TTTTSTSRPT1020
 1021 TTTPRSTTTT TTSRPTTTTP RSTTTPSTSR PTTTTPRSTT TTSTSRPTTT TPRSTTKTST1080
 1081 CAPTTTTPRS TTTTTTSRPT TTTPRSTTTT TTSRPTTTTP RSTTTPCTSR PTTTTPRSTT1140
 1141 TTTTSRPTTT TPRSTTTPCP TTTPSASPTR TTTTRRPCPC HPQPPYQIPP WSWWYPNPTY1200
 1201 PNPVWPWQPN PVVPQWPQMP GYPNQWPQLP GYPQQLPPPL PSPQWPWSWP KPPVVQPGDC1260
 1261 ENICENLLKG VKYQEDLIRR CLCTRT

YRC Informatics Platform - Version 3.0
Created and Maintained by: Michael Riffle