YRC Logo
PROTEIN SEARCH:
Descriptions Names[Advanced Search]

View Philius Transmembrane Prediction Details

Prediction Overview

Protein: gi|25496719
Protein type: Globular with Signal Peptide
Type Confidence: 0.99
From Publication: Reynolds et al. (2008)


Predicted Protein Segments [Show List]:

Prediction Image Map

(Place mouse over segments for confidence values.)


Philius confidence legend

Prediction Sequence Map

Legend: Transmembrane Helix, Non-Cytoplasmic, Cytoplasmic, Signal Peptide

(Place mouse over sequence for confidence values.)

      1          11         21         31         41         51         
      |          |          |          |          |          |          
    1 MLKNKITLLL SSIYILGSIS TPTLASELTK NSSALTKRSS SNNFSLNKNH VFTPITSNVN  60
   61 GSNAKNNLNT KVQTNTASSS MPNTNPKQAT NNSKILVNPK LNQASSPNEG ITPKKQASIP 120
  121 YTNVTDNKNT FKNESSINNE APIIPKDTSK TKSTSSAQTK GSNDNNIPSN NTSTNTSKNE 180
  181 NPSNTDIKTT EAPANAPIKD TPNNQSDSAL AKNKALSNNN LAADSSQTSK VTSSNNDAPK 240
  241 VNTTSTDKKA SNLNNDSQDG WVTKDGKKYY YVNGVQQKGF QSINKSIYYF NDDGSMQTGW 300
  301 LKYNSNSYYF DASGVMLTGL QNINGTYYGF NDDGKLLTGL QAINNNYYYF NNDGVMQTGW 360
  361 ITCNDSKYYF DNNGVMQTGL VHINNKYYGF GNDGKLLTGL QNINNYTYYF DSNGVMQTDW 420
  421 ITIDGSKYYF SVNGVMQTGI IYISGYYYGF ANDGKLLTGL QVINGNSYYF DTNGIRLVSR 480
  481 WITIDGKDYY FNQDGILTDN WINYDGKYYF YISGVKQTGL QNIDGNYYYF DSSGIMQTGL 540
  541 QKIDGKTYYF GDNGIRQIGW ITYQNNKYYF NSDGSMQTDL KIYSYSTSPY NYHYQYYGFD 600
  601 NDGKLLTGLQ TIKGNTYYFD SNGISQMGWV NIDGKDFYFN SNSIMTENWV INDEKYYFYI 660
  661 NNVKQTGFQY INGKYYYFDP DGIMQTGFQT ISGNTYYLDD NGVKQTGWVT IKGKDYYFDG 720
  721 NGVMINYWVF DNDKTYYYIN GNMQTGAISI NNHYYGFDDN GIMQTGWQRI NGRTYYFDNN 780
  781 GAAKTGLVTY EGKTYYFNTY YAYLDTGFIY FNNNYYFLDN NGVVRTGWIN YSNNRYYLDS 840
  841 TGVRVTGFQT IDGNKYYFDS SGAMCTSFIT VNGNTYGFSK DGIMLTGWQT ILSSNYSSYN 900
  901 IYYFNSDGSA QKGFFTYLGK TYYFEPNYGY MLLGYNYING KYYYFDNDGV IQTGWVTDRS 960
  961 SKYYLDPSGA AVTGFQNING DKYYFNSSGI MQTGLVYVNP DYYGFDDNGH ILTGMHSING1020
 1021 YIYYFDSTGK AQKGFVTYLG KTYYFNTNMY TGFVNANNNL YYFDNEGVMQ TGWINYNSNR1080
 1081 YYFSATGASV TGFQTIDGNK YCFDSNGAIY TDVVTINGST YGFNTDGIML TGWQTIRYNR1140
 1141 GYSSYFNTYY FNSDGTAKTG FFTYLNKTYY FNPSDGRMLQ GYQYINGNHY YFAPDGTMQT1200
 1201 GWITNGSSKY YLDPSGAAVT GLQTINGNKY CFDSNGILQH NGIFYIGNTY YGSDNNGIML1260
 1261 TGLQLINGYL YCFNSDGSVK TGLVTYLGKT YYFDSYSVSG FQNINNNTYY FGNDGTMQTG1320
 1321 WVNYGYYRYY LNDSGIKVTG WQTIDGNKYY FDYYGAKTGI VNIDGNYYGF NNSGVMLTGW1380
 1381 QHINGSTYYF NSNGIANTGF ITYLGKTYYF DSYGRMQIGS MTINGTSYYF YANGVMKTST1440
 1441 DSPNTLAVGW VRDSYYYQYY LNAAGTKLTG LQTIDGNTYY FDSNGIMQTG IITINGNRYG1500
 1501 FGVNGVMLYG LQFINNNTYY SNSYGISQTG FVTLSGNTYY FDSYGEMRIG LTYINNNYYY1560
 1561 FNSKGIMETG WISYLRYANP NGILLTGFQT INGKTYYFNS DGSLLYDLQY INGSYYGFDK1620
 1621 NGVMLYGLQT IGGNTYYLNS NGISQSGFIT LNGKTYYFDS YYGMRTGIQN INNNYYFFGD1680
 1681 NGTLQTGWIS QDNLRYYANS SGVCLTGLQT IDGKKYYFNS YARMETGLVY INNTYYGFDN1740
 1741 DGTLLYSWHN INGRMYCFNT DGTVKTGWIN YLGRSCYLDS SQGFLSTGLL TIGHNIYYFG1800
 1801 SDYSMKTGWV TSGSSKYYFN ESGIMLTGFQ TIDGNTYYFD SYGNSTTGTR SINGNCYGFN1860
 1861 DDGIMLTGWQ TISGNNYYFN PDGTAKIGLN TYEGKTYYFS TGGYTQTGII NINSNTYYFG1920
 1921 YDGALKTGWI RNNYIYYADN NGIIQTGLKT IDGKNYLFNY SGIMMNGIQS INNNYYGFDN1980
 1981 DGGMLFGVHS INGQTYYFNA DGSVKTGWIP YEGKMYYANP SYCTGFATIN NNTYYFDNNG2040
 2041 AMETGIITVD NSKYYINSYG IRETGYKIID GKTYYFNPNY SGIMQTGVIS LNGNYYGFDD2100
 2101 NGVMQIGLQK LNGNTYYFNS NGTAITGWTT LGSNKYYFNP NSYGAAEVGI ESINGHYYYF2160
 2161 NNNGIMQTGV QRINGYVYCF NNDGTAMNGF QSINGNTYYL NIYGCTYTGW QTINSNRYYF2220
 2221 NSDGVMLTGA QNITGYIYGF DSNGIMLTGV QTIAGNTYDF SSNGTATTGW VILSNKTYYF2280
 2281 SPSLGYKLTG FITVSGDNYY LDADGVLQTG WVTVDGNKYY LNSNGVRQTG FLTLNNNKYY2340
 2341 FDTNGVMQTG FTTINNNVYY FNDDGIMQTL WITIDYNKYY FDSTGIRLIG FQIIDGKKYY2400
 2401 FNSNGIMLTG VQTIGNKFYG FDNYGVMLTG VQDIDNHTYN FNQDGSASTG WTKLSDKTYY2460
 2461 FSPSLGYKLT GFQTIDDKTY YFDTDGAILS GWITANSNKY YLDSNGVVQT GFLTLDNNKY2520
 2521 YLNSSGVMQT GIVPINGTYY GFGQDGIMLT GIQKLNDQTY YFNSDGTMFT GWFKDSSSSQ2580
 2581 HYFDSNGMML TGLKDVNGNK YYFNENGVMQ TGLITFSNNK YYFDQNGIMQ TGWQNLSGCN2640
 2641 YYFNNDGVMQ TGVNTINDSI YGFDSNGIML TGWQTINSKT YYFAPNGIAK NGWLNYRGKK2700
 2701 YYFDPQYAYM ITGFKTITGC TYYFDQDGVM QTGVVSIDGG TYGFNSLGFL LKGWQNIDSK2760
 2761 TYYFDSNGLA PKGLKTIDGS IYYFSSDGYL EKDTKIIVDG ITYKINDNGT ATEVKNI

YRC Informatics Platform - Version 3.0
Created and Maintained by: Michael Riffle