General Information: |
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Name(s) found: |
sdk-PC /
FBpp0070126
[FlyBase]
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Description(s) found:
Found 17 descriptions. SHOW ALL |
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Organism: | Drosophila melanogaster |
Length: | 2232 amino acids |
Gene Ontology: |
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Cellular Component: | NONE FOUND |
Biological Process: | NONE FOUND |
Molecular Function: | NONE FOUND |
Sequence: |
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Sequence: [PDR BLAST] [ProtParam] |
1 11 21 31 41 51 | | | | | | 1 MLKSAASSLR RRRPKTTITA TLAIEMPSQP KLASLLAVLV LLCYCDSCFF CYADANLQQQ 60 61 NSIVQQQQLQ APRFTTHPSS SGSIVSEGST KILQCHALGY PQPTYRWLKD GVPVGDFSSS 120 121 QFYRFHSTRR EDAGSYQCIA RNDAGSIFSE KSDVVVAYMG IFENTTEGRL TVISGHPAIF 180 181 DMPPIESIPV PSVMWQSEDG PLNYDIKYAF THANQLIILS ADENDRKGYR AKAINTQLGK 240 241 EESSAFVHLN VSGDPYIEVA PEIIVRPQDV KVKVGTGVVE LQCIANARPL HELETLWLKD 300 301 GLAVETAGVR HTLNDPWNRT LALLQANSSH SGEYTCQVRL RSGGYPAVSA SARLQILEPP 360 361 LFFTPMRAET FGEFGGQVQL TCDVVGEPTP QVKWFRNAES VDAHIESGRY TLNTDNTLVI 420 421 KKLILDDAAM FQCLAINEAG ENSASTWLRV KTSAPIMELP PQNVTALDGK DATISCRAVG 480 481 SPNPNITWIY NETQLVDISS RVQILESGDL LISNIRSVDA GLYICVRANE AGSVKGEAYL 540 541 SVLVRTQIIQ PPVDTTVLLG LTATLQCKVS SDPSVPYNID WYREGQSSTP ISNSQRIGVQ 600 601 ADGQLEIQAV RASDVGSYAC VVTSPGGNET RAARLSVIEL PFPPSNVKVE RLPEPQQRSI 660 661 NVSWTPGFDG NSPISKFIIQ RREVSELEKF VGPVPDPLLN WITELSNVSA DQRWILLENL 720 721 KAATVYQFRV SAVNRVGEGS PSEPSNVVEL PQEAPSGPPV GFVGSARSMS EIITQWQPPL 780 781 EEHRNGQILG YILRYRLFGY NNVPWSYQNI TNEAQRNFLI QELITWKDYI VQIAAYNNMG 840 841 VGVYTEGSKI KTKEGVPEAP PTNVKVEAIN STAARCRWTP PNPQQINGIN QGYKIQAWQR 900 901 RLIDGEWRDI ERRMKTVPPS LIDPLAEQTA ILGGLEKFTE YNISVLCFTD PGDGVASSQV 960 961 AVMTMDDVPD EVTGLHFDDV SDRSVKVLWA PPRASNGILT GYTVRYQVKD RPDTLKSFNL1020 1021 TADDTELTVN QLQATTHYWF EIVAWTRVGS GIPKTATIQS GVEPVLPHAP TALALSNIEA1080 1081 FSVVLQFTPG FDGNSSITKW KVEGQTARNM TWFTICEIND PDAETLTVTG LVPFTQYRLR1140 1141 LSASNVVGSS KPSEATKDFQ TIQARPKHPP FNVTVRAMSA QQLRVRWIPL QQTEWYGNPR1200 1201 GYNISYKQLV KTPGTIKYVP RSVVIEDHTA NSHVLDSLEE WTLYEVKMNA CNDVGCSKES1260 1261 DTAVERTREA VPSYGPLDVQ ANATSSTTVV VQWGEVPRQH RNGQIDGYKV FYAAADRGQQ1320 1321 VLHKTIPNNA TFTTTLTELK KYVVYHVQVL AYTRLGNGAL STPPIRVQTF EDTPGVPSNV1380 1381 SFPDVSLTMA RIIWDVPVDP NGKILAYQVT YTLNGSAMLN YSREFPPSDR TFRATELLPG1440 1441 KYYSFSCTAQ TRLGWGKIAT ALVYTTNNRE RPQAPSVPQI SRSQIQAHQI TFSWTPGRDG1500 1501 FAPLRYYTVE MRENEGRWQP LPERVDPSLS SFTAVGLRPY MTYQFRIQAT NDLGPSAFSR1560 1561 ESVIVRTLPA APAVGVGGLK VVPITTTSVR VQWSALETAL WNGDASTGGY RILYQQLSDF1620 1621 PTALQSTPKT DVHGINENSV VLSDLQQDRN YEIVVLPFNS QGPGPATPPA AVYVGEAVPT1680 1681 GEPRAVDAAP ISSTEVRLLW KPPKQSMQNG DILGYKIYYL VTYSPQALEP GRKWEEEIEV1740 1741 VSATATSHSL VFLDKFTEYR IQLLAFNPAG DGPRSAPITV KTLPGVPSAP LHLRFSDITM1800 1801 QSLEVTWDPP KFLNGEILGY LVTYETTEEN EKFSKQVKQK VSNTTLRVQN LEEEVTYTFT1860 1861 VRAQTSVDYG PGISENVTTG PQDGSPVAPR DLILTKTLSS VEMHWINGPS GRGPILGYLI1920 1921 EAKKREKGEP SFVYDSRWTK IEQTRKGMMQ DFTVSYHILM PSTAYTFRVI AYNRYGISFP1980 1981 VYSKDSILTP SKLHLEYGYL QHKPFYRQTW FMVSLAATSI VIIVMVIAVL CVKSKSYKYK2040 2041 QEAQKTLEES MAMSIDERQE LALELYRSRH GVGTGTLNSV GTLRSGTLGT LGRKSTSRPP2100 2101 PGVHLGKSPP RPSPASVAYH SDEESLKCYD ENPDDSSVTE KPSEVSSSEA SQHSESENES2160 2161 VRSDPHSFVN HYANVNDSLR QSWKKTKPVR NYSSYTDSEP EGSAVMSLNG GQIIVNNMAR2220 2221 SRAPLPGFSS FV |
NOT SHOWING SINGLE HITS. [ Show Single Hits ]
New Feature: Upload Your Own Microscopy Data
Domains predicted:
# | Region(s) | Method | Confidence | Match Description | |
1 | View Details | [1..71] | N/A | No confident structure predictions are available. | |
2 | View Details | [72..162] | 64.69897 | Axonin-1 | |
3 | View Details | [163..645] | 16.69897 | No description for 2ocwA was found. | |
4 | View Details | [646..749] | 36.69897 | No description for 2nziA was found. | |
5 | View Details | [750..858] | 12.522879 | No description for 2edxA was found. | |
6 | View Details | [859..1061] | 22.522879 | Integin beta-4 subunit | |
7 | View Details | [1062..1160] | 4.9 | Neural cell adhesion molecule 1, NCAM | |
8 | View Details | [1161..1275] | 35.30103 | FRAGMENT OF HUMAN FIBRONECTIN ENCOMPASSING TYPE-III REPEATS 7 THROUGH 10 | |
9 | View Details | [1276..2000] | 38.69897 | No description for 2v5yA was found. | |
10 | View Details | [2001..2105] | N/A | No confident structure predictions are available. | |
11 | View Details | [2106..2232] | 3.39794 | The solution structure of the second fibronectin type III domain of mouse Ephrin type-A receptor 1 |
Functions predicted (by domain):
# | Gene Ontology predictions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 |
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8 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10 | No functions predicted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: Reynolds et al. 2008. Manuscript submitted |