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View Philius Transmembrane Prediction Details

Prediction Overview

Protein: FLO1
Protein type: Transmembrane with Signal Peptide
Type Confidence: 0.81
Topology Confidence: 0.72
From Publication: Reynolds et al. (2008)


Predicted Protein Segments [Show List]:

Prediction Image Map

(Place mouse over segments for confidence values.)


Philius confidence legend

Prediction Sequence Map

Legend: Transmembrane Helix, Non-Cytoplasmic, Cytoplasmic, Signal Peptide

(Place mouse over sequence for confidence values.)

      1          11         21         31         41         51         
      |          |          |          |          |          |          
    1 MTMPHRYMFL AVFTLLALTS VASGATEACL PAGQRKSGMN INFYQYSLKD SSTYSNAAYM  60
   61 AYGYASKTKL GSVGGQTDIS IDYNIPCVSS SGTFPCPQED SYGNWGCKGM GACSNSQGIA 120
  121 YWSTDLFGFY TTPTNVTLEM TGYFLPPQTG SYTFKFATVD DSAILSVGGA TAFNCCAQQQ 180
  181 PPITSTNFTI DGIKPWGGSL PPNIEGTVYM YAGYYYPMKV VYSNAVSWGT LPISVTLPDG 240
  241 TTVSDDFEGY VYSFDDDLSQ SNCTVPDPSN YAVSTTTTTT EPWTGTFTST STEMTTVTGT 300
  301 NGVPTDETVI VIRTPTTAST IITTTEPWNS TFTSTSTELT TVTGTNGVRT DETIIVIRTP 360
  361 TTATTAITTT EPWNSTFTST STELTTVTGT NGLPTDETII VIRTPTTATT AMTTTQPWND 420
  421 TFTSTSTELT TVTGTNGLPT DETIIVIRTP TTATTAMTTT QPWNDTFTST STELTTVTGT 480
  481 NGLPTDETII VIRTPTTATT AMTTTQPWND TFTSTSTEIT TVTGTNGLPT DETIIVIRTP 540
  541 TTATTAMTTP QPWNDTFTST STEMTTVTGT NGLPTDETII VIRTPTTATT AITTTEPWNS 600
  601 TFTSTSTEMT TVTGTNGLPT DETIIVIRTP TTATTAITTT QPWNDTFTST STEMTTVTGT 660
  661 NGLPTDETII VIRTPTTATT AMTTTQPWND TFTSTSTEIT TVTGTTGLPT DETIIVIRTP 720
  721 TTATTAMTTT QPWNDTFTST STEMTTVTGT NGVPTDETVI VIRTPTSEGL ISTTTEPWTG 780
  781 TFTSTSTEMT TVTGTNGQPT DETVIVIRTP TSEGLVTTTT EPWTGTFTST STEMTTITGT 840
  841 NGVPTDETVI VIRTPTSEGL ISTTTEPWTG TFTSTSTEMT TITGTNGQPT DETVIVIRTP 900
  901 TSEGLISTTT EPWTGTFTST STEMTHVTGT NGVPTDETVI VIRTPTSEGL ISTTTEPWTG 960
  961 TFTSTSTEVT TITGTNGQPT DETVIVIRTP TSEGLISTTT EPWTGTFTST STEMTTVTGT1020
 1021 NGQPTDETVI VIRTPTSEGL VTTTTEPWTG TFTSTSTEMS TVTGTNGLPT DETVIVVKTP1080
 1081 TTAISSSLSS SSSGQITSSI TSSRPIITPF YPSNGTSVIS SSVISSSVTS SLFTSSPVIS1140
 1141 SSVISSSTTT STSIFSESSK SSVIPTSSST SGSSESETSS AGSVSSSSFI SSESSKSPTY1200
 1201 SSSSLPLVTS ATTSQETASS LPPATTTKTS EQTTLVTVTS CESHVCTESI SPAIVSTATV1260
 1261 TVSGVTTEYT TWCPISTTET TKQTKGTTEQ TTETTKQTTV VTISSCESDV CSKTASPAIV1320
 1321 STSTATINGV TTEYTTWCPI STTESRQQTT LVTVTSCESG VCSETASPAI VSTATATVND1380
 1381 VVTVYPTWRP QTANEESVSS KMNSATGETT TNTLAAETTT NTVAAETITN TGAAETKTVV1440
 1441 TSSLSRSNHA ETQTASATDV IGHSSSVVSV SETGNTKSLT SSGLSTMSQQ PRSTPASSMV1500
 1501 GYSTASLEIS TYAGSANSLL AGSGLSVFIA SLLLAII

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