YRC Logo
PROTEIN SEARCH:
Descriptions Names[Advanced Search]

View Philius Transmembrane Prediction Details

Prediction Overview

Protein: gi|88188037, gi|...
Protein type: Globular with Signal Peptide
Type Confidence: 0.99
From Publication: Reynolds et al. (2008)


Predicted Protein Segments [Show List]:

Prediction Image Map

(Place mouse over segments for confidence values.)


Philius confidence legend

Prediction Sequence Map

Legend: Transmembrane Helix, Non-Cytoplasmic, Cytoplasmic, Signal Peptide

(Place mouse over sequence for confidence values.)

      1          11         21         31         41         51         
      |          |          |          |          |          |          
    1 MKINYYKLSG PLLIFLFLLI GSYACADNFT DVPTPEPIEP EGQFDWNELI EEEFEEPVDW  60
   61 EEIDISESLD WDEPVPSPET EPAPETDTAP VENLEYEISL ANGAVYGVGL NEEEGLLEFE 120
  121 SISSIESVEE DFFGSWADFD IDFELSTANG AIFGEGLASE EGPPVIEALS TIEPVLIVEK 180
  181 SENEIEQDNF EFSTANGAIF GESLSILEEE FQSGISPFML QVEEPVSEIE KKGAQVTTPS 240
  241 GSQEITDEGP TLATPNYDGA TGTKPGAQVL LPDKDKKEKP ESEKISEVEP VVTVIPEVTP 300
  301 TTVPVQETEE DKEKKGAQVT TPSGSQEISD EGQTLATPNY DGITGTKPGA QVLLPNKDKK 360
  361 EKPETEKTSD VEPVVTVSPE VTPTTVPIQE TEEEKEKKGA QVTTPSGSQE ITDEGTTLAT 420
  421 PNYDGTTGTK PGAQVLLPDK DKKEKPESEK TSDIEPVVTV SPEPTSTIIP VQETEEDKEK 480
  481 KGAQVTTPSG SQEITDEGTT LATPNYDGTT GTKPGAQVLL PDKDKKEKPE SEKTSDIEPV 540
  541 VTVSPEPTST IIPVQETEEE KEKKGAQVTT PSGSQEITDE GTTLTTPNYD GTTGTKPGAQ 600
  601 VLLPDKDKKE KPESEKASDV EPVVTVSPEA TPIIVPDQET EEEKEKKGAQ VTTPSGSQEI 660
  661 TDEGTTLTTP NYDGTTGTKP GAQVLLPDKD KKEKPESDKS SSVEPVVTIS PDVTPTPVTV 720
  721 QETEEDKEKK GAQVTTPSGS QEITDEGATL ATPNYDGTTG IKPGAQVLLP DKDKKEKPES 780
  781 EKTSSVEPVV TVIPVVTTTT PVVVATVSPT STPVITTGNS GKLNDKANVN SQRTATPTVM 840
  841 PTVTSTPVVT PTTPVVVATV SPTSTPVITT GNSGKLNDKA NINSQRTATP TVMPTVTSTP 900
  901 VVTPTTPVVV ATVSPTSTPV ITTGNSGKLN DKANVNSQRT ATPTVMPTVT STPVVTLPTP 960
  961 VVVATVSPTS TPVITTGNSG KLNDNANVNS QRTATPTVMP TVTSTPAVIH ELGEVVTPEP1020
 1021 TVTPEIGEEV TPEPTVTPEF GEEVTPEPTV TPEVGEEVTP EPMLTPELSE EVTVEPTVTP1080
 1081 EVGEEVTVEP TVTPELGEDV TPEPTVTPEF GEEVTPEPTV TPEYGEEVTP EPTVTPEYGE1140
 1141 EVTPEPTVTP EYGEEVTPEP TVTPDLGEEV TPEPTVTPVI GEEDTPEPTV TPEVGEEVTP1200
 1201 EPTVTPELGE EVTPEPTVTP EFGEVVTPEP TVTPELGEEV TPEPTVTSEL GEEVTPEPTV1260
 1261 TPEFGEEVTP EPTVTPEVGE EVTPEPTVTP VIGEEDTPEP TVTPEVGEEV TPEPTVTPVI1320
 1321 GEEDTPEPTV TPELGEEVTP EPTVTPELGE EVTPEPTVTS ELGEEVTPEP TVTPEFGEEV1380
 1381 TPEPTVTPEV GEEVTPEPTV TPEVGEEVTP EPTVTPELGE EVTPEPTVTP ELGEEVTPEP1440
 1441 TVTPELGEEV TPEPTVTPEL GEEVTPEPTV TPELGEEVTP EPTVTPELGE EVTPEPTVTP1500
 1501 EYGEEVTPEP TVTPELGEEV TPEPTVTPEL GEEVTPEPTV TPEYGEEVTP EPTVTPELGE1560
 1561 EVTPEPTVTP ELGEEVTPEP TVTPELGEEV TPEPTVTPEL GEEVTAEPTV TPEIGKEFTP1620
 1621 EPTVTPEVGE EVTAEPTVTP EVGEEVTAEP TVTPEVGEEV TAEPTVTPEI GEEFTPEPTV1680
 1681 TPEVGEEITP EPTVSPEPTE EVTVEPTVTP EFGKEVTAEP TVTPELGEEV TPEPTVSPEP1740
 1741 TEEVTVEPTV TPEFGKEVTA EPTVTPELGE EITPEPTVTP ELGEEVTPEP TLTPESTEEV1800
 1801 TPEPTVTPEL GEEVTPEPTL TPEPTEEVTP EPTMTPEPTE EDTPEPTMTP EPTEEVTPEP1860
 1861 TMTPEPTEEV TPEPTMTPEP TEEVTPEPTL TPEPTEEVTP EPTLTPEPTE EVTPEPTLTP1920
 1921 EPTEEVTPEP TMTPEPTEEV TPEPTLTPEP TEEVTPEPTL TPEPTEEVTP EPTMTPEPTE1980
 1981 EVTPEPTMTP EPTEEVTPEP TMTPEPTEEV TPEPTMTPEP TEEVTPEPTM TPEPTEEVTP2040
 2041 EPTMTPEPTE EVTPEPTLTP EPTEEVTPEP TLTPEPTEEV TPEPTLTPEP TEEVTPEPTM2100
 2101 TPEPTEEVTP EPTLTPEPTE EVTPEIQPII TPNPDEGLLS KIPEEPSQIE SIEIVNGSIN2160
 2161 LLEQPENIEV YINGEPQGLT PLLITGVDPG KYLLTFEHED GYEDQVVEVP DTGGEVKPKR2220
 2221 TEPVYKIAVL AGEKEPCKDC CTIQEVHAKT SQMDYSEVFK ISTVAMKPDE SGSIPYTLYW2280
 2281 NGKPWYRGTL KPDEDEKAEG CENCVVMEDY IREVAPPGTF ELKLDDGRLC TSSDNMGRLT2340
 2341 FFGIEGIPLP SSP

YRC Informatics Platform - Version 3.0
Created and Maintained by: Michael Riffle