YRC Logo
PROTEIN SEARCH:
Descriptions Names[Advanced Search]

View Philius Transmembrane Prediction Details

Prediction Overview

Protein: gi|49481374, gi|...
Protein type: Transmembrane
Type Confidence: 0.96
Topology Confidence: 0.50
From Publication: Reynolds et al. (2008)


Predicted Protein Segments [Show List]:

Prediction Image Map

(Place mouse over segments for confidence values.)


Philius confidence legend

Prediction Sequence Map

Legend: Transmembrane Helix, Non-Cytoplasmic, Cytoplasmic, Signal Peptide

(Place mouse over sequence for confidence values.)

      1          11         21         31         41         51         
      |          |          |          |          |          |          
    1 MVKVVEGNGG KSKIKSPLNS NFKILSDLVG PTFPPVPTGM TGITGSTGAT GETGATGPTG  60
   61 ATGETGSTGN TGATGATGPT GSTGVTGSTG ATGSTGPTGN TGAMGNTGPT GETGVTGSTG 120
  121 PTGSTGATGN TGVTGSTGPT GETGATGPTG STGAIGNTGA TGETGSTGNT GPTGATGATG 180
  181 STGPTGSTGV TGNTGATGST GATGNTGPTG STGVTGNTGA TGAIGPTGST GPTGETGVTG 240
  241 STGPTGNTGV TGNTGPIGET GVTGSTGATG NTGATGSTGP TGETGVTGST GPTGSTGATG 300
  301 NTGATGETGA TGSTGVTGST GATGSTGATG NTGATGETGP TGNTGVTGST GPTGETGVTG 360
  361 STGPTGNTGV TGSTGPTGNT GVTGSTGPTG ETGVTGSTGP TGNTGVTGST GPTGETGVTG 420
  421 STGPTGNTGA TGNTGPTGET GVTGSTGPTG STGVTGNTGT TGSTGNTGPT GATGSTGPTG 480
  481 EAGATGSTGV TGSTGPTGET GATGSTGSTG ETGATGSTGV TGSTGPTGET GATGSTGVTG 540
  541 STGPTGETGA TGSTGPTGNT GATGNTGPTG ETGATGNTGP TGSTGVTGNT GATGETGPTG 600
  601 STGATGETGS TGNTGPTGST GVTGNTGATG STGATGNTGP TGSTGETGAT GNTGPTGETG 660
  661 VTGSTGPTGN TGATGETGET GVTGPTGSTG VTGSTGPTGS TGAPGNTGAT GETGPTGNTG 720
  721 VTGSTGPTGS TGVTGNTGAT GETGPTGSTG ETGVTGNTGP TGETGVTGST GATGNTGPTG 780
  781 ETGATGETGA TGSTGVIGST GATGNTGATG NTGATGSTGP TGNTGATGST GATGNTGPTG 840
  841 ETGPTGSTGV TGNTGATGST GVTGNTGATG ATGATGSTGP TGSTGATGVT GSTGPTGSTG 900
  901 TTGNTGVTGD TGPTGATGVS TTATYAFANN TSGSVISVLL GGTNIPLPNN QNIGPGITVS 960
  961 GGNTVFTVAN AGNYYIAYTI NLTAGLLVSS RITVNGSPLA GTINSPTVAT GSFSATIIAS1020
 1021 LPAGAAVSLQ LFGVVALATL STATPGATLT IIRLS

YRC Informatics Platform - Version 3.0
Created and Maintained by: Michael Riffle