YRC Logo
PROTEIN SEARCH:
Descriptions Names[Advanced Search]

View Philius Transmembrane Prediction Details

Prediction Overview

Protein: MUC17
Protein type: Transmembrane with Signal Peptide
Type Confidence: 0.99
Topology Confidence: 0.94
From Publication: Reynolds et al. (2008)


Predicted Protein Segments [Show List]:

Prediction Image Map

(Place mouse over segments for confidence values.)


Philius confidence legend

Prediction Sequence Map

Legend: Transmembrane Helix, Non-Cytoplasmic, Cytoplasmic, Signal Peptide

(Place mouse over sequence for confidence values.)

      1          11         21         31         41         51         
      |          |          |          |          |          |          
    1 MPRPGTMALC LLTLVLSLLP PQAAAEQGLS VNRAVWDGGG CISQGDVLNR QCQQLSQHVR  60
   61 TGSATNTATG TTSTNVVEPR MYLSCSTNPE MTSIESSVTS DTPGVSSTRM TPTESRTTSE 120
  121 STSDSTTLFP SPTEDTSSPT TPEGTDVPMS TPSEESISST MAFVSTAPLP SFEAYTSLTY 180
  181 KVDMSTPLTT STQASSSPTT PESTTIPKST NSEGSTPLTS MPASTMKVAS SEAITLLTTP 240
  241 VEISTPVTIS AQASSSPTTA EGPSLSNSAP SGGSTPLTRM PLSVMLVVSS EASTLSTTPA 300
  301 ATNIPVITST EASSSPTTAE GTSIPTSTYT EGSTPLTSTP ASTMPVATSE MSTLSITPVD 360
  361 TSTLVTTSTE PSSLPTTAEA TSMLTSTLSE GSTPLTNMPV STILVASSEA STTSTIPVDS 420
  421 KTFVTTASEA SSSPTTAEDT SIATSTPSEG STPLTSMPVS TTPVASSEAS NLSTTPVDSK 480
  481 TQVTTSTEAS SSPPTAEVNS MPTSTPSEGS TPLTSMSVST MPVASSEAST LSTTPVDTST 540
  541 PVTTSSEASS SSTTPEGTSI PTSTPSEGST PLTNMPVSTR LVVSSEASTT STTPADSNTF 600
  601 VTTSSEASSS STTAEGTSMP TSTYSERGTT ITSMSVSTTL VASSEASTLS TTPVDSNTPV 660
  661 TTSTEATSSS TTAEGTSMPT STYTEGSTPL TSMPVNTTLV ASSEASTLST TPVDTSTPVT 720
  721 TSTEASSSPT TADGASMPTS TPSEGSTPLT SMPVSKTLLT SSEASTLSTT PLDTSTHITT 780
  781 STEASCSPTT TEGTSMPIST PSEGSPLLTS IPVSITPVTS PEASTLSTTP VDSNSPVTTS 840
  841 TEVSSSPTPA EGTSMPTSTY SEGRTPLTSM PVSTTLVATS AISTLSTTPV DTSTPVTNST 900
  901 EARSSPTTSE GTSMPTSTPG EGSTPLTSMP DSTTPVVSSE ARTLSATPVD TSTPVTTSTE 960
  961 ATSSPTTAEG TSIPTSTPSE GTTPLTSTPV SHTLVANSEA STLSTTPVDS NTPLTTSTEA1020
 1021 SSPPPTAEGT SMPTSTPSEG STPLTRMPVS TTMVASSETS TLSTTPADTS TPVTTYSQAS1080
 1081 SSSTTADGTS MPTSTYSEGS TPLTSVPVST RLVVSSEAST LSTTPVDTSI PVTTSTEASS1140
 1141 SPTTAEGTSI PTSPPSEGTT PLASMPVSTT LVVSSEANTL STTPVDSKTQ VATSTEASSP1200
 1201 PPTAEVTSMP TSTPGERSTP LTSMPVRHTP VASSEASTLS TSPVDTSTPV TTSAETSSSP1260
 1261 TTAEGTSLPT STTSEGSTLL TSIPVSTTLV TSPEASTLLT TPVDTKGPVV TSNEVSSSPT1320
 1321 PAEGTSMPTS TYSEGRTPLT SIPVNTTLVA SSAISILSTT PVDNSTPVTT STEACSSPTT1380
 1381 SEGTSMPNSN PSEGTTPLTS IPVSTTPVVS SEASTLSATP VDTSTPGTTS AEATSSPTTA1440
 1441 EGISIPTSTP SEGKTPLKSI PVSNTPVANS EASTLSTTPV DSNSPVVTST AVSSSPTPAE1500
 1501 GTSIAISTPS EGSTALTSIP VSTTTVASSE INSLSTTPAV TSTPVTTYSQ ASSSPTTADG1560
 1561 TSMQTSTYSE GSTPLTSLPV STMLVVSSEA NTLSTTPIDS KTQVTASTEA SSSTTAEGSS1620
 1621 MTISTPSEGS PLLTSIPVST TPVASPEAST LSTTPVDSNS PVITSTEVSS SPTPAEGTSM1680
 1681 PTSTYTEGRT PLTSITVRTT PVASSAISTL STTPVDNSTP VTTSTEARSS PTTSEGTSMP1740
 1741 NSTPSEGTTP LTSIPVSTTP VLSSEASTLS ATPIDTSTPV TTSTEATSSP TTAEGTSIPT1800
 1801 STLSEGMTPL TSTPVSHTLV ANSEASTLST TPVDSNSPVV TSTAVSSSPT PAEGTSIATS1860
 1861 TPSEGSTALT SIPVSTTTVA SSETNTLSTT PAVTSTPVTT YAQVSSSPTT ADGSSMPTST1920
 1921 PREGRPPLTS IPVSTTTVAS SEINTLSTTL ADTRTPVTTY SQASSSPTTA DGTSMPTPAY1980
 1981 SEGSTPLTSM PLSTTLVVSS EASTLSTTPV DTSTPATTST EGSSSPTTAG GTSIQTSTPS2040
 2041 ERTTPLAGMP VSTTLVVSSE GNTLSTTPVD SKTQVTNSTE ASSSATAEGS SMTISAPSEG2100
 2101 SPLLTSIPLS TTPVASPEAS TLSTTPVDSN SPVITSTEVS SSPIPTEGTS MQTSTYSDRR2160
 2161 TPLTSMPVST TVVASSAIST LSTTPVDTST PVTNSTEARS SPTTSEGTSM PTSTPSEGST2220
 2221 PFTSMPVSTM PVVTSEASTL SATPVDTSTP VTTSTEATSS PTTAEGTSIP TSTLSEGTTP2280
 2281 LTSIPVSHTL VANSEVSTLS TTPVDSNTPF TTSTEASSPP PTAEGTSMPT STSSEGNTPL2340
 2341 TRMPVSTTMV ASFETSTLST TPADTSTPVT TYSQAGSSPT TADDTSMPTS TYSEGSTPLT2400
 2401 SVPVSTMPVV SSEASTHSTT PVDTSTPVTT STEASSSPTT AEGTSIPTSP PSEGTTPLAS2460
 2461 MPVSTTPVVS SEAGTLSTTP VDTSTPMTTS TEASSSPTTA EDIVVPISTA SEGSTLLTSI2520
 2521 PVSTTPVASP EASTLSTTPV DSNSPVVTST EISSSATSAE GTSMPTSTYS EGSTPLRSMP2580
 2581 VSTKPLASSE ASTLSTTPVD TSIPVTTSTE TSSSPTTAKD TSMPISTPSE VSTSLTSILV2640
 2641 STMPVASSEA STLSTTPVDT RTLVTTSTGT SSSPTTAEGS SMPTSTPGER STPLTNILVS2700
 2701 TTLLANSEAS TLSTTPVDTS TPVTTSAEAS SSPTTAEGTS MRISTPSDGS TPLTSILVST2760
 2761 LPVASSEAST VSTTAVDTSI PVTTSTEASS SPTTAEVTSM PTSTPSETST PLTSMPVNHT2820
 2821 PVASSEAGTL STTPVDTSTP VTTSTKASSS PTTAEGIVVP ISTASEGSTL LTSIPVSTTP2880
 2881 VASSEASTLS TTPVDTSIPV TTSTEGSSSP TTAEGTSMPI STPSEVSTPL TSILVSTVPV2940
 2941 AGSEASTLST TPVDTRTPVT TSAEASSSPT TAEGTSMPIS TPGERRTPLT SMSVSTMPVA3000
 3001 SSEASTLSRT PADTSTPVTT STEASSSPTT AEGTGIPIST PSEGSTPLTS IPVSTTPVAI3060
 3061 PEASTLSTTP VDSNSPVVTS TEVSSSPTPA EGTSMPISTY SEGSTPLTGV PVSTTPVTSS3120
 3121 AISTLSTTPV DTSTPVTTST EAHSSPTTSE GTSMPTSTPS EGSTPLTYMP VSTMLVVSSE3180
 3181 DSTLSATPVD TSTPVTTSTE ATSSTTAEGT SIPTSTPSEG MTPLTSVPVS NTPVASSEAS3240
 3241 ILSTTPVDSN TPLTTSTEAS SSPPTAEGTS MPTSTPSEGS TPLTSMPVST TTVASSETST3300
 3301 LSTTPADTST PVTTYSQASS SPPIADGTSM PTSTYSEGST PLTNMSFSTT PVVSSEASTL3360
 3361 STTPVDTSTP VTTSTEASLS PTTAEGTSIP TSSPSEGTTP LASMPVSTTP VVSSEVNTLS3420
 3421 TTPVDSNTLV TTSTEASSSP TIAEGTSLPT STTSEGSTPL SIMPLSTTPV ASSEASTLST3480
 3481 TPVDTSTPVT TSSPTNSSPT TAEVTSMPTS TAGEGSTPLT NMPVSTTPVA SSEASTLSTT3540
 3541 PVDSNTFVTS SSQASSSPAT LQVTTMRMST PSEGSSSLTT MLLSSTYVTS SEASTPSTPS3600
 3601 VDRSTPVTTS TQSNSTPTPP EVITLPMSTP SEVSTPLTIM PVSTTSVTIS EAGTASTLPV3660
 3661 DTSTPVITST QVSSSPVTPE GTTMPIWTPS EGSTPLTTMP VSTTRVTSSE GSTLSTPSVV3720
 3721 TSTPVTTSTE AISSSATLDS TTMSVSMPME ISTLGTTILV STTPVTRFPE SSTPSIPSVY3780
 3781 TSMSMTTASE GSSSPTTLEG TTTMPMSTTS ERSTLLTTVL ISPISVMSPS EASTLSTPPG3840
 3841 DTSTPLLTST KAGSFSIPAE VTTIRISITS ERSTPLTTLL VSTTLPTSFP GASIASTPPL3900
 3901 DTSTTFTPST DTASTPTIPV ATTISVSVIT EGSTPGTTIF IPSTPVTSST ADVFPATTGA3960
 3961 VSTPVITSTE LNTPSTSSSS TTTSFSTTKE FTTPAMTTAA PLTYVTMSTA PSTPRTTSRG4020
 4021 CTTSASTLSA TSTPHTSTSV TTRPVTPSSE SSRPSTITSH TIPPTFPPAH SSTPPTTSAS4080
 4081 STTVNPEAVT TMTTRTKPST RTTSFPTVTT TAVPTNTTIK SNPTSTPTVP RTTTCFGDGC4140
 4141 QNTASRCKNG GTWDGLKCQC PNLYYGELCE EVVSSIDIGP PETISAQMEL TVTVTSVKFT4200
 4201 EELKNHSSQE FQEFKQTFTE QMNIVYSGIP EYVGVNITKL RLGSVVVEHD VLLRTKYTPE4260
 4261 YKTVLDNATE VVKEKITKVT TQQIMINDIC SDMMCFNTTG TQVQNITVTQ YDPEEDCRKM4320
 4321 AKEYGDYFVV EYRDQKPYCI SPCEPGFSVS KNCNLGKCQM SLSGPQCLCV TTETHWYSGE4380
 4381 TCNQGTQKSL VYGLVGAGVV LMLIILVALL MLVFRSKREV KRQKYRLSQL YKWQEEDSGP4440
 4441 APGTFQNIGF DICQDDDSIH LESIYSNFQP SLRHIDPETK IRIQRPQVMT TSF

YRC Informatics Platform - Version 3.0
Created and Maintained by: Michael Riffle